17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0966 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0966  hypothetical protein  100 
 
 
49 aa  99.4  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00430801  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0821  RelB/DinJ family addiction module antitoxin  75.56 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.83996 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4957  hypothetical protein  58.7 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.878072  hitchhiker  0.000117069 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7599  hypothetical protein  55.32 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2786  hypothetical protein  58.33 
 
 
161 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0493789  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2652  hypothetical protein  58.33 
 
 
161 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2709  hypothetical protein  58.33 
 
 
110 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462809  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0139  hypothetical protein  63.16 
 
 
153 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2916  hypothetical protein  63.16 
 
 
153 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3180  hypothetical protein  62.86 
 
 
152 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.588168  hitchhiker  0.000000131612 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  51.28 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0139  hypothetical protein  62.16 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.882218  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1995  hypothetical protein  67.74 
 
 
87 aa  47  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0257344  normal  0.0183843 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1573  hypothetical protein  58.06 
 
 
60 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.863098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3169  hypothetical protein  60.71 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304276  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3232  addiction module antitoxin  46.34 
 
 
102 aa  40.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5983  hypothetical protein  64.29 
 
 
153 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>