33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3180 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3180  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  305  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.588168  hitchhiker  0.000000131612 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7599  hypothetical protein  78.29 
 
 		 152 aa  253  8e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0139  hypothetical protein  71.71 
 
 		 153 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2916  hypothetical protein  71.71 
 
 		 153 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0139  hypothetical protein  71.05 
 
 		 153 aa  205  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.882218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0821  RelB/DinJ family addiction module antitoxin  59.86 
 
 		 146 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.83996 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7133  hypothetical protein  57.6 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.233753 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5983  hypothetical protein  54.01 
 
 		 153 aa  140  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4957  hypothetical protein  45.89 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.878072  hitchhiker  0.000117069 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4990  hypothetical protein  46.27 
 
 		 154 aa  124  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3568  hypothetical protein  55.45 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.811641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2786  hypothetical protein  37.41 
 
 		 161 aa  86.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0493789  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2652  hypothetical protein  38.26 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2709  hypothetical protein  48.94 
 
 		 110 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462809  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0966  hypothetical protein  65.96 
 
 		 49 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00430801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  63.89 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0040  hypothetical protein  33.77 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0861806  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1995  hypothetical protein  62.5 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0257344  normal  0.0183843 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1573  hypothetical protein  51.22 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.863098  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5830  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  58.62 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3232  addiction module antitoxin  50 
 
 		 102 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3169  hypothetical protein  66.67 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2090  RelB antitoxin  55 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406192  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3758  addiction module antitoxin  56.67 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3527  hypothetical protein  37.74 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.268548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2279  hypothetical protein  43.18 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000345992  hitchhiker  0.00000000000000772672 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1257  hypothetical protein  40.91 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482621  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2239  addiction module antitoxin  58.62 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.635404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3591  addiction module antitoxin  51.72 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4340  hypothetical protein  48.72 
 
 		 62 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3473  hypothetical protein  51.35 
 
 		 58 aa  41.2  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.415439 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0058  hypothetical protein  38 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.963562  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0622  addiction module antitoxin  51.72 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>