20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1257 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1257  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  128  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2279  hypothetical protein  96.83 
 
 
75 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000345992  hitchhiker  0.00000000000000772672 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4340  hypothetical protein  73.33 
 
 
62 aa  97.1  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0263  hypothetical protein  65.52 
 
 
62 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1147  hypothetical protein  67.86 
 
 
63 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.348678 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1700  hypothetical protein  63.27 
 
 
64 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1399  hypothetical protein  63.27 
 
 
64 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.102306  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0058  hypothetical protein  45.9 
 
 
66 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.963562  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3169  hypothetical protein  49.09 
 
 
64 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304276  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1995  hypothetical protein  51.11 
 
 
87 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0257344  normal  0.0183843 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0194  hypothetical protein  51.11 
 
 
65 aa  54.7  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160171  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1573  hypothetical protein  50.98 
 
 
60 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.863098  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00557  hypothetical protein  40.68 
 
 
60 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3758  addiction module antitoxin  45.24 
 
 
99 aa  43.9  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7599  hypothetical protein  42.5 
 
 
152 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2652  hypothetical protein  41.46 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  48.48 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2786  hypothetical protein  41.46 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0493789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2709  hypothetical protein  43.59 
 
 
110 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462809  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3473  hypothetical protein  35.56 
 
 
58 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.415439 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>