21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1700 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1399  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.102306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1700  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1147  hypothetical protein  69.09 
 
 		 63 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.348678 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0263  hypothetical protein  77.55 
 
 		 62 aa  82  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2279  hypothetical protein  65.31 
 
 		 75 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000345992  hitchhiker  0.00000000000000772672 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4340  hypothetical protein  60 
 
 		 62 aa  68.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1257  hypothetical protein  63.27 
 
 		 63 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482621  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1995  hypothetical protein  44.83 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0257344  normal  0.0183843 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0194  hypothetical protein  50.88 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160171  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0058  hypothetical protein  45.45 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.963562  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1573  hypothetical protein  46.55 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.863098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3169  hypothetical protein  40 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3758  addiction module antitoxin  55 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00557  hypothetical protein  48.89 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2239  addiction module antitoxin  55 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.635404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3527  hypothetical protein  41.67 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.268548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4999  addiction module antitoxin  52.5 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0622  addiction module antitoxin  52.5 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5830  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  43.9 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3473  hypothetical protein  51.43 
 
 		 58 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.415439 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3591  addiction module antitoxin  51.52 
 
 		 97 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>