21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4340 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4340  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  126  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1257  hypothetical protein  73.33 
 
 
63 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2279  hypothetical protein  73.33 
 
 
75 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000345992  hitchhiker  0.00000000000000772672 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0263  hypothetical protein  62.9 
 
 
62 aa  88.2  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1147  hypothetical protein  66.07 
 
 
63 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.348678 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1700  hypothetical protein  60 
 
 
64 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1399  hypothetical protein  60 
 
 
64 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.102306  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0058  hypothetical protein  51.72 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.963562  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3169  hypothetical protein  48.33 
 
 
64 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304276  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1573  hypothetical protein  56.6 
 
 
60 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.863098  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0194  hypothetical protein  57.78 
 
 
65 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1995  hypothetical protein  58.54 
 
 
87 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0257344  normal  0.0183843 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00557  hypothetical protein  51.22 
 
 
60 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  55.56 
 
 
100 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2652  hypothetical protein  39.58 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7599  hypothetical protein  46.15 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2786  hypothetical protein  39.58 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0493789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2709  hypothetical protein  39.58 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462809  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3473  hypothetical protein  51.35 
 
 
58 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.415439 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2090  RelB antitoxin  41.46 
 
 
98 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406192  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3758  addiction module antitoxin  56.67 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>