13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3473 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3473  hypothetical protein  100 
 
 		 58 aa  117  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.415439 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1995  hypothetical protein  46.94 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0257344  normal  0.0183843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3169  hypothetical protein  54.29 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2652  hypothetical protein  46 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2709  hypothetical protein  48.78 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462809  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2786  hypothetical protein  46 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0493789  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4340  hypothetical protein  51.35 
 
 		 62 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1399  hypothetical protein  51.43 
 
 		 64 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.102306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1700  hypothetical protein  51.43 
 
 		 64 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0821  RelB/DinJ family addiction module antitoxin  47.5 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.83996 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1573  hypothetical protein  50 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.863098  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1257  hypothetical protein  35.56 
 
 		 63 aa  40.4  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1147  hypothetical protein  31.25 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.348678 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>