29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1573 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1573  hypothetical protein  100 
 
 		 60 aa  124  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.863098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1995  hypothetical protein  60.34 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0257344  normal  0.0183843 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0194  hypothetical protein  60.42 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160171  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0058  hypothetical protein  49.12 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.963562  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3169  hypothetical protein  47.37 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1147  hypothetical protein  50.94 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.348678 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4340  hypothetical protein  56.6 
 
 		 62 aa  57.4  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3527  hypothetical protein  41.07 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.268548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1700  hypothetical protein  46.55 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1399  hypothetical protein  46.55 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.102306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00557  hypothetical protein  53.19 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1257  hypothetical protein  50.98 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2279  hypothetical protein  50.98 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000345992  hitchhiker  0.00000000000000772672 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3591  addiction module antitoxin  54.05 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7599  hypothetical protein  51.16 
 
 		 152 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5830  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  47.37 
 
 		 98 aa  50.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3758  addiction module antitoxin  52.63 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0263  hypothetical protein  47.17 
 
 		 62 aa  48.9  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2652  hypothetical protein  66.67 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2786  hypothetical protein  66.67 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0493789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2709  hypothetical protein  68.97 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462809  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3180  hypothetical protein  51.35 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.588168  hitchhiker  0.000000131612 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2239  addiction module antitoxin  44.74 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.635404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4999  addiction module antitoxin  39.47 
 
 		 99 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  55.56 
 
 		 100 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0821  RelB/DinJ family addiction module antitoxin  55.17 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.83996 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0966  hypothetical protein  58.06 
 
 		 49 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00430801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3473  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.415439 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0622  addiction module antitoxin  36.84 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>