29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3169 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3169  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1995  hypothetical protein  63.64 
 
 		 87 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0257344  normal  0.0183843 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0058  hypothetical protein  53.33 
 
 		 66 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.963562  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0194  hypothetical protein  46.88 
 
 		 65 aa  67  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160171  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1573  hypothetical protein  47.37 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.863098  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4340  hypothetical protein  48.33 
 
 		 62 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1147  hypothetical protein  43.4 
 
 		 63 aa  57  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.348678 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1257  hypothetical protein  49.09 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2279  hypothetical protein  47.27 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000345992  hitchhiker  0.00000000000000772672 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3527  hypothetical protein  44 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.268548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1399  hypothetical protein  40 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.102306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1700  hypothetical protein  40 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3758  addiction module antitoxin  47.73 
 
 		 99 aa  50.8  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2652  hypothetical protein  44 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2786  hypothetical protein  44 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0493789  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0263  hypothetical protein  41.27 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2709  hypothetical protein  44 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462809  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3473  hypothetical protein  54.29 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.415439 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2239  addiction module antitoxin  47.62 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.635404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5830  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  43.9 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0821  RelB/DinJ family addiction module antitoxin  65.52 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.83996 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3180  hypothetical protein  66.67 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.588168  hitchhiker  0.000000131612 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00557  hypothetical protein  50 
 
 		 60 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  48.89 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4999  addiction module antitoxin  40.48 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3591  addiction module antitoxin  45 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7599  hypothetical protein  59.26 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0966  hypothetical protein  60.71 
 
 		 49 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00430801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0622  addiction module antitoxin  45.45 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>