16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3527 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3527  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  131  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.268548  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0058  hypothetical protein  53.33 
 
 
66 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.963562  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1573  hypothetical protein  41.07 
 
 
60 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.863098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1995  hypothetical protein  50 
 
 
87 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0257344  normal  0.0183843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3169  hypothetical protein  44 
 
 
64 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304276  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3758  addiction module antitoxin  45.83 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2239  addiction module antitoxin  43.75 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.635404  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0194  hypothetical protein  38.3 
 
 
65 aa  47  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160171  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4999  addiction module antitoxin  45 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0622  addiction module antitoxin  42 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1399  hypothetical protein  41.67 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.102306  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1700  hypothetical protein  41.67 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5830  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  39.58 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3591  addiction module antitoxin  36.96 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1147  hypothetical protein  41.46 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.348678 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7599  hypothetical protein  33.96 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>