21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2652 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2652  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  328  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2786  hypothetical protein  99.38 
 
 
161 aa  326  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0493789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2709  hypothetical protein  98.18 
 
 
110 aa  223  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462809  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3180  hypothetical protein  38.69 
 
 
152 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.588168  hitchhiker  0.000000131612 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0821  RelB/DinJ family addiction module antitoxin  40.38 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.83996 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7599  hypothetical protein  30.41 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5983  hypothetical protein  34.13 
 
 
153 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4957  hypothetical protein  34.44 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.878072  hitchhiker  0.000117069 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0966  hypothetical protein  58.33 
 
 
49 aa  54.3  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00430801  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2916  hypothetical protein  32.89 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1995  hypothetical protein  51.11 
 
 
87 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0257344  normal  0.0183843 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0139  hypothetical protein  32.89 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7133  hypothetical protein  38.37 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.233753 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6310  hypothetical protein  33.73 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3169  hypothetical protein  44 
 
 
64 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304276  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1573  hypothetical protein  52.5 
 
 
60 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.863098  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3473  hypothetical protein  46 
 
 
58 aa  48.1  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.415439 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0139  hypothetical protein  29.93 
 
 
153 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.882218  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4340  hypothetical protein  39.58 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1257  hypothetical protein  41.46 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2279  hypothetical protein  43.59 
 
 
75 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000345992  hitchhiker  0.00000000000000772672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>