21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0139 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0139  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  297  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.882218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2916  hypothetical protein  93.46 
 
 		 153 aa  261  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0139  hypothetical protein  93.46 
 
 		 153 aa  261  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7599  hypothetical protein  67.59 
 
 		 152 aa  207  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3180  hypothetical protein  72.52 
 
 		 152 aa  199  8e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.588168  hitchhiker  0.000000131612 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0821  RelB/DinJ family addiction module antitoxin  54.93 
 
 		 146 aa  161  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.83996 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7133  hypothetical protein  54.33 
 
 		 154 aa  133  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.233753 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5983  hypothetical protein  52.63 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4957  hypothetical protein  44.52 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.878072  hitchhiker  0.000117069 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4990  hypothetical protein  45.16 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3568  hypothetical protein  43.81 
 
 		 113 aa  94.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.811641  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2652  hypothetical protein  31.97 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2786  hypothetical protein  31.97 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0493789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2709  hypothetical protein  39.36 
 
 		 110 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462809  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0966  hypothetical protein  61.7 
 
 		 49 aa  60.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00430801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  58.97 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3232  addiction module antitoxin  50 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0040  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  48.5  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0861806  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2090  RelB antitoxin  53.49 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406192  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0014  hypothetical protein  38.03 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1995  hypothetical protein  44.74 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0257344  normal  0.0183843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>