24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0139 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_2916  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0139  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0139  hypothetical protein  93.46 
 
 
153 aa  256  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.882218  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7599  hypothetical protein  67.81 
 
 
152 aa  209  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3180  hypothetical protein  73.85 
 
 
152 aa  202  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.588168  hitchhiker  0.000000131612 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0821  RelB/DinJ family addiction module antitoxin  54.93 
 
 
146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.83996 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4957  hypothetical protein  46.58 
 
 
147 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.878072  hitchhiker  0.000117069 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7133  hypothetical protein  55.12 
 
 
154 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.233753 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5983  hypothetical protein  53.38 
 
 
153 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4990  hypothetical protein  46.03 
 
 
154 aa  107  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3568  hypothetical protein  45.71 
 
 
113 aa  95.9  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.811641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2786  hypothetical protein  42 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0493789  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2652  hypothetical protein  42 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2709  hypothetical protein  41.58 
 
 
110 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462809  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0966  hypothetical protein  65.96 
 
 
49 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00430801  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  58.97 
 
 
100 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0040  hypothetical protein  33.33 
 
 
92 aa  48.5  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0861806  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3232  addiction module antitoxin  55 
 
 
102 aa  47.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2090  RelB antitoxin  53.49 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406192  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1995  hypothetical protein  47.37 
 
 
87 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0257344  normal  0.0183843 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0014  hypothetical protein  36.62 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3169  hypothetical protein  51.52 
 
 
64 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304276  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7897  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  43.9 
 
 
102 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373381  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8393  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  43.9 
 
 
102 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>