16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4957 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4957  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  303  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.878072  hitchhiker  0.000117069 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0821  RelB/DinJ family addiction module antitoxin  52.82 
 
 
146 aa  159  9e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.83996 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7599  hypothetical protein  43.15 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5983  hypothetical protein  49.18 
 
 
153 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7133  hypothetical protein  47.54 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.233753 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3180  hypothetical protein  45.45 
 
 
152 aa  126  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.588168  hitchhiker  0.000000131612 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2916  hypothetical protein  46.58 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0139  hypothetical protein  46.58 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0139  hypothetical protein  44.52 
 
 
153 aa  110  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.882218  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4990  hypothetical protein  40.31 
 
 
154 aa  102  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3568  hypothetical protein  42.72 
 
 
113 aa  93.2  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.811641  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0966  hypothetical protein  58.7 
 
 
49 aa  62  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00430801  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2652  hypothetical protein  34.44 
 
 
161 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2709  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462809  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2786  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0493789  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0040  hypothetical protein  30.26 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0861806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>