16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5983 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5983  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  308  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7133  hypothetical protein  87.58 
 
 
154 aa  275  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.233753 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0821  RelB/DinJ family addiction module antitoxin  63.43 
 
 
146 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.83996 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7599  hypothetical protein  53.19 
 
 
152 aa  144  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3180  hypothetical protein  56.8 
 
 
152 aa  140  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.588168  hitchhiker  0.000000131612 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4957  hypothetical protein  49.18 
 
 
147 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.878072  hitchhiker  0.000117069 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2916  hypothetical protein  53.38 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0139  hypothetical protein  53.38 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4990  hypothetical protein  47.9 
 
 
154 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0139  hypothetical protein  51.09 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.882218  normal 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3568  hypothetical protein  46.6 
 
 
113 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.811641  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0040  hypothetical protein  37.97 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0861806  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2786  hypothetical protein  40.48 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0493789  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2652  hypothetical protein  40.48 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2709  hypothetical protein  40.48 
 
 
110 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462809  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0966  hypothetical protein  64.29 
 
 
49 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00430801  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>