19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00557 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00557  hypothetical protein  100 
 
 
60 aa  121  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0058  hypothetical protein  49.06 
 
 
66 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.963562  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1147  hypothetical protein  55.81 
 
 
63 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.348678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1573  hypothetical protein  53.19 
 
 
60 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.863098  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0194  hypothetical protein  51.11 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1995  hypothetical protein  44.78 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0257344  normal  0.0183843 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2239  addiction module antitoxin  57.89 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.635404  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2279  hypothetical protein  42.37 
 
 
75 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000345992  hitchhiker  0.00000000000000772672 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1257  hypothetical protein  40.68 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482621  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3758  addiction module antitoxin  52.27 
 
 
99 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1700  hypothetical protein  48.89 
 
 
64 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4340  hypothetical protein  51.22 
 
 
62 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1399  hypothetical protein  48.89 
 
 
64 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.102306  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0622  addiction module antitoxin  52.5 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4999  addiction module antitoxin  52.63 
 
 
99 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3169  hypothetical protein  50 
 
 
64 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304276  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5830  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  56.67 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  51.61 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3591  addiction module antitoxin  50 
 
 
97 aa  40  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>