71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4666 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4666  RelB antitoxin  100 
 
 		 101 aa  197  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0384532  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3232  addiction module antitoxin  80.41 
 
 		 102 aa  155  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8393  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  88.37 
 
 		 102 aa  152  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7897  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  88.37 
 
 		 102 aa  152  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373381  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  64.95 
 
 		 100 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2090  RelB antitoxin  64.95 
 
 		 98 aa  118  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406192  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5830  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  55.56 
 
 		 98 aa  95.5  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2239  addiction module antitoxin  57.5 
 
 		 99 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.635404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0622  addiction module antitoxin  53.09 
 
 		 97 aa  88.2  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4999  addiction module antitoxin  56.41 
 
 		 99 aa  88.2  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3758  addiction module antitoxin  52.56 
 
 		 99 aa  86.3  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1223  addiction module antitoxin  54.17 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.528862  normal  0.677479 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3591  addiction module antitoxin  50.65 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3782  DNA-damage-inducible protein  55.56 
 
 		 86 aa  68.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6453  RelB antitoxin  54.55 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190461  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2158  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  54.55 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000610229  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4297  addiction module antitoxin  54.55 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000000082937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4380  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  52.38 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3908  addiction module antitoxin  50.79 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339882  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0254  addiction module antitoxin  58.82 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1163  addiction module antitoxin  49.21 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0259  addiction module antitoxin  58.82 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3394  addiction module antitoxin  58.82 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0238  addiction module antitoxin component DinJ  46.67 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3381  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  58.82 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0270  addiction module antitoxin component DinJ  58.82 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.686864 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00225  hypothetical protein  58.82 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00221  predicted antitoxin of YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  58.82 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2867  addiction module antitoxin  56.36 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.041013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4999  addiction module antitoxin  56.86 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3887  DNA-damage-inducible protein J  56.86 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0379  DNA-damage-inducible protein J, putative  50 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3825  DNA-damage-inducible protein J  54.9 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2503  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  45.45 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0833  DNA-damage-inducible protein J  47.37 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.407516 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4452  addiction module antitoxin  49.09 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128999  hitchhiker  0.00983141 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3767  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  41.43 
 
 		 90 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36920  RelB antitoxin  46.94 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3344  addiction module antitoxin  47.92 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0218664  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1589  DNA-damage-inducible protein J  41.67 
 
 		 89 aa  48.9  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0499234  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1299  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  41.67 
 
 		 89 aa  48.9  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000279332  hitchhiker  0.000000000509211 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5118  addiction module antitoxin  40 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.659791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1874  addiction module antitoxin  45.1 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  0.190999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2916  hypothetical protein  51.16 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0139  hypothetical protein  51.16 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1922  RelB antitoxin  41.51 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.119991  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1573  DNA-damage-inducible protein J, putative  29.87 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0246869  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2034  RelB antitoxin  44.9 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0966  hypothetical protein  51.22 
 
 		 49 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00430801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2226  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  40.85 
 
 		 79 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0088475  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0435  DNA-damage-inducible protein J, putative  28.05 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0978363  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0969  RelB protein  42.22 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2510  RelB antitoxin  40.48 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.400211  normal  0.98229 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11400  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  24.1 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0393  hypothetical protein  29.73 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00921245  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1183  hypothetical protein  35.29 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.291195  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4829  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  35 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4700  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  35 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.85974 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4850  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  35 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4795  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  35 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0302  hypothetical protein  25.37 
 
 		 92 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.342642  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0434  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  35 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4715  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  33.9 
 
 		 80 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0139  hypothetical protein  52.63 
 
 		 153 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.882218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0821  RelB/DinJ family addiction module antitoxin  48.72 
 
 		 146 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.83996 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4468  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  36.76 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.791173  normal  0.577271 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4331  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  36.76 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4646  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  36.76 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4396  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  36.76 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  0.921307 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7599  hypothetical protein  45 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0507  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  34.62 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.038501 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>