37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1573 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1573  DNA-damage-inducible protein J, putative  100 
 
 
85 aa  174  5e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0246869  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0393  hypothetical protein  48.81 
 
 
93 aa  77.8  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00921245  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0302  hypothetical protein  49.28 
 
 
92 aa  75.9  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.342642  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2606  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  39.53 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.680421  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0663  hypothetical protein  37.5 
 
 
85 aa  63.5  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2025  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  38.55 
 
 
87 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00570451  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2574  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  35.8 
 
 
88 aa  60.1  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000349457  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1068  addiction module antitoxin  30.77 
 
 
84 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0145416  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1524  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  36.51 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.376806  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1377  RelB antitoxin  35.14 
 
 
94 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0852734  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00900  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  40 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0518  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  42.86 
 
 
98 aa  50.4  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00235093 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1714  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  46.94 
 
 
93 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3187  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  39.34 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0435  DNA-damage-inducible protein J, putative  42.55 
 
 
97 aa  48.9  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0978363  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0738  hypothetical protein  34.57 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000842316  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1831  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  34.78 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7897  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  28.57 
 
 
102 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373381  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0511  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  51.22 
 
 
92 aa  47.4  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928195 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8393  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  28.57 
 
 
102 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0506  DNA-damage-inducible protein J, putative  43.4 
 
 
90 aa  47  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4201  RelB antitoxin  33.33 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1074  putative DNA-damage-inducibile protein  38.78 
 
 
89 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4666  RelB antitoxin  29.87 
 
 
101 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0384532  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1183  hypothetical protein  36.73 
 
 
101 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.291195  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11400  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  35.29 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3445  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  34.69 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0414  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  43.75 
 
 
92 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0747  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  33.33 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000814382 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3232  addiction module antitoxin  27.4 
 
 
102 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0150  hypothetical protein  32.65 
 
 
103 aa  41.6  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000721335  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1477  RelB antitoxin  35.82 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.400201  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3908  addiction module antitoxin  26.25 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339882  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3573  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  44.44 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1496  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  28.99 
 
 
85 aa  40.8  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0833  DNA-damage-inducible protein J  24.36 
 
 
87 aa  40.4  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.407516 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2158  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  31.37 
 
 
87 aa  40  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000610229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>