51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0302 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0302  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  185  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.342642  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1573  DNA-damage-inducible protein J, putative  49.28 
 
 		 85 aa  75.9  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0246869  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3187  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  43.62 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1714  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  38.46 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1831  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  35.79 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0414  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  39.77 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1524  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  37.18 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.376806  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0506  DNA-damage-inducible protein J, putative  35.11 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2025  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  31.82 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00570451  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00900  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  41.51 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2574  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  54.76 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000349457  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0435  DNA-damage-inducible protein J, putative  50 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0978363  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0663  hypothetical protein  28.89 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1163  addiction module antitoxin  30 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0393  hypothetical protein  43.75 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00921245  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4297  addiction module antitoxin  32.18 
 
 		 87 aa  51.2  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000000082937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6453  RelB antitoxin  32.18 
 
 		 87 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190461  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1074  putative DNA-damage-inducibile protein  31.11 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11400  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  29.89 
 
 		 92 aa  50.4  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0518  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  41.67 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00235093 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4201  RelB antitoxin  28.74 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2158  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  32.18 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000610229  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1047  DNA-damage-inducible protein J  30.34 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3767  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  34.78 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3908  addiction module antitoxin  28.41 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339882  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3782  DNA-damage-inducible protein  35.38 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1496  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  28.89 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0511  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  44 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928195 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2575  addiction module antitoxin  29.21 
 
 		 95 aa  48.1  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167878 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1183  hypothetical protein  42.22 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.291195  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1377  RelB antitoxin  35.19 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0852734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0833  DNA-damage-inducible protein J  34.29 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.407516 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3445  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  36.92 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4380  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  33.85 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3573  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  30.85 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0577  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  30.43 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1061  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  27.91 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1477  RelB antitoxin  33.33 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.400201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0747  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  28.74 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000814382 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0150  hypothetical protein  39.58 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000721335  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2034  RelB antitoxin  26.44 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0983  RelB antitoxin  31.65 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0548  putative RelB antitoxin  38.24 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.483871  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0507  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  35.42 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.038501 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2867  addiction module antitoxin  33.82 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.041013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2606  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  32 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.680421  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4839  addiction module antitoxin  34.78 
 
 		 98 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4666  RelB antitoxin  25.37 
 
 		 101 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0384532  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1922  RelB antitoxin  30.43 
 
 		 88 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.119991  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0379  DNA-damage-inducible protein J, putative  32.65 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2863  addiction module antitoxin  28.74 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421266  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>