38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2025 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2025  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  100 
 
 
87 aa  178  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00570451  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0393  hypothetical protein  63.1 
 
 
93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00921245  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0663  hypothetical protein  56.25 
 
 
85 aa  98.6  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1714  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  52.94 
 
 
93 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1524  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  59.7 
 
 
87 aa  87.4  6e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.376806  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1074  putative DNA-damage-inducibile protein  69.81 
 
 
89 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0414  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  65.38 
 
 
92 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1831  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  50 
 
 
90 aa  80.9  0.000000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3187  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  67.92 
 
 
95 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2606  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  43.53 
 
 
89 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.680421  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0506  DNA-damage-inducible protein J, putative  66.67 
 
 
90 aa  73.9  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0518  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  44.93 
 
 
98 aa  63.9  0.0000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00235093 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1573  DNA-damage-inducible protein J, putative  38.55 
 
 
85 aa  62.8  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0246869  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2574  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  41.98 
 
 
88 aa  62  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000349457  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1183  hypothetical protein  46.55 
 
 
101 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.291195  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0150  hypothetical protein  47.17 
 
 
103 aa  60.1  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000721335  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11400  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  43.14 
 
 
92 aa  58.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3445  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  42.86 
 
 
101 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3573  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  52 
 
 
92 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0738  hypothetical protein  33.33 
 
 
86 aa  57  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000842316  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0302  hypothetical protein  31.82 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.342642  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1068  addiction module antitoxin  33.33 
 
 
84 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0145416  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0511  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  47.73 
 
 
92 aa  51.2  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928195 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0577  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  37.25 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1377  RelB antitoxin  38.46 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0852734  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3591  addiction module antitoxin  30.56 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1061  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  39.13 
 
 
108 aa  47  0.00008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4201  RelB antitoxin  28.4 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5830  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  27.4 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0435  DNA-damage-inducible protein J, putative  40.43 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0978363  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0747  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  33.78 
 
 
104 aa  44.3  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000814382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1223  addiction module antitoxin  30.19 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.528862  normal  0.677479 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2575  addiction module antitoxin  36.84 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.167878 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0622  addiction module antitoxin  31.03 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1047  DNA-damage-inducible protein J  28.38 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532229  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4759  addiction module antitoxin  39.13 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.262133  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1496  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  25.68 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3758  addiction module antitoxin  30.36 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>