47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3187 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3187  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  100 
 
 		 95 aa  193  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1714  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  65.59 
 
 		 93 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0414  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  63.33 
 
 		 92 aa  120  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0506  DNA-damage-inducible protein J, putative  50 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1831  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  47.67 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3573  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  47.19 
 
 		 92 aa  89.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1074  putative DNA-damage-inducibile protein  47.25 
 
 		 89 aa  84.7  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2025  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  67.92 
 
 		 87 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00570451  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0511  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  48.19 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928195 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0393  hypothetical protein  64.71 
 
 		 93 aa  75.5  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00921245  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0302  hypothetical protein  43.62 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.342642  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0663  hypothetical protein  65.22 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1524  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  63.04 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.376806  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11400  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  44.78 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0518  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  37.8 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00235093 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1183  hypothetical protein  42.65 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.291195  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1377  RelB antitoxin  38.46 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0852734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4201  RelB antitoxin  37.78 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2575  addiction module antitoxin  33.71 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167878 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3445  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  47.17 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3767  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  44.78 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1061  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  30.23 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0150  hypothetical protein  45.28 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000721335  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2574  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  39.71 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000349457  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2034  RelB antitoxin  30.43 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0435  DNA-damage-inducible protein J, putative  44.68 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0978363  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0983  RelB antitoxin  38.71 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1573  DNA-damage-inducible protein J, putative  39.34 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0246869  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0577  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  32.05 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1163  addiction module antitoxin  29.35 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2606  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  38.46 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.680421  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3908  addiction module antitoxin  30.23 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339882  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1068  addiction module antitoxin  35.48 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0145416  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1496  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  31.25 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0833  DNA-damage-inducible protein J  27.17 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.407516 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0507  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  34 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.038501 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00900  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  32.39 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1299  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  28.41 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000279332  hitchhiker  0.000000000509211 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1589  DNA-damage-inducible protein J  28.41 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0499234  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1477  RelB antitoxin  34.52 
 
 		 98 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.400201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1749  RelB antitoxin  32.26 
 
 		 110 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00498154  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1922  RelB antitoxin  30.68 
 
 		 88 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.119991  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1047  DNA-damage-inducible protein J  35.42 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0747  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  27.17 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000814382 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2158  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  27.47 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000610229  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4759  addiction module antitoxin  37.78 
 
 		 165 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.262133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0548  putative RelB antitoxin  28.24 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.483871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>