70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_11400 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_11400  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  100 
 
 		 92 aa  188  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1061  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  57.75 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1074  putative DNA-damage-inducibile protein  41.76 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3767  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  36.96 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1831  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  43.08 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1714  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  42.86 
 
 		 93 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0577  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  48.08 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3187  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  44.78 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1377  RelB antitoxin  43.42 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0852734  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0506  DNA-damage-inducible protein J, putative  41.79 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0414  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  38.81 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0518  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  47.46 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00235093 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2025  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  43.14 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00570451  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0150  hypothetical protein  48.08 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000721335  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2575  addiction module antitoxin  38.46 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167878 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4201  RelB antitoxin  43.75 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3445  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  35.06 
 
 		 101 aa  57  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1496  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  37.88 
 
 		 85 aa  57  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0393  hypothetical protein  32.95 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00921245  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0511  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  40.91 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928195 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3782  DNA-damage-inducible protein  38.27 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0663  hypothetical protein  37.14 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1183  hypothetical protein  34.62 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.291195  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0302  hypothetical protein  29.89 
 
 		 92 aa  50.4  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.342642  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1524  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  34.92 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.376806  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0507  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  32.31 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.038501 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1068  addiction module antitoxin  36.99 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0145416  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36920  RelB antitoxin  35.16 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0238  addiction module antitoxin component DinJ  28.95 
 
 		 86 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5830  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  29.59 
 
 		 98 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00225  hypothetical protein  28.05 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00221  predicted antitoxin of YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  28.05 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3394  addiction module antitoxin  28.05 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4759  addiction module antitoxin  48.78 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.262133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0270  addiction module antitoxin component DinJ  28.05 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.686864 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0259  addiction module antitoxin  28.05 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0254  addiction module antitoxin  28.05 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4999  addiction module antitoxin  29.63 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3381  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  28.05 
 
 		 86 aa  47  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2867  addiction module antitoxin  33.82 
 
 		 87 aa  47  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.041013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0622  addiction module antitoxin  38.78 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3825  DNA-damage-inducible protein J  31.33 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3887  DNA-damage-inducible protein J  31.33 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2090  RelB antitoxin  31.17 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406192  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1922  RelB antitoxin  38.71 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.119991  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  30.99 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1749  RelB antitoxin  31.87 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00498154  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1573  DNA-damage-inducible protein J, putative  35.29 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0246869  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0548  putative RelB antitoxin  31.67 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.483871  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2158  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  33.82 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000610229  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6453  RelB antitoxin  33.82 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190461  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4297  addiction module antitoxin  33.82 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000000082937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3591  addiction module antitoxin  36.17 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0747  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  31.25 
 
 		 104 aa  43.5  0.0009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000814382 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4452  addiction module antitoxin  35.29 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128999  hitchhiker  0.00983141 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0721  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  30.34 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4666  RelB antitoxin  24.1 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0384532  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2239  addiction module antitoxin  33.82 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.635404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1223  addiction module antitoxin  30 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.528862  normal  0.677479 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4839  addiction module antitoxin  33.33 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605483  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1084  hypothetical protein  28.05 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2503  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  34.78 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3573  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  35.29 
 
 		 92 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2034  RelB antitoxin  36.23 
 
 		 91 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4999  addiction module antitoxin  32.61 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0435  DNA-damage-inducible protein J, putative  33.33 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0978363  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3758  addiction module antitoxin  31.34 
 
 		 99 aa  40.4  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2574  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  24.29 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000349457  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3908  addiction module antitoxin  29.67 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339882  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00900  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  26.98 
 
 		 110 aa  40  0.01  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>