45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1084 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1084  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  169  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2575  addiction module antitoxin  38.46 
 
 
95 aa  65.5  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.167878 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0747  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  54.9 
 
 
104 aa  62  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000814382 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3908  addiction module antitoxin  32.53 
 
 
87 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339882  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4201  RelB antitoxin  37.5 
 
 
121 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0721  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  36.84 
 
 
83 aa  57.8  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1299  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  34.94 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000279332  hitchhiker  0.000000000509211 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1589  DNA-damage-inducible protein J  34.94 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0499234  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4380  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  32.05 
 
 
95 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1874  addiction module antitoxin  37.18 
 
 
85 aa  54.7  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  0.190999 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1496  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  33.73 
 
 
85 aa  53.5  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5118  addiction module antitoxin  34.18 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.659791  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1163  addiction module antitoxin  31.25 
 
 
87 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0518  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  40 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00235093 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1749  RelB antitoxin  37.29 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00498154  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1377  RelB antitoxin  31.43 
 
 
94 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0852734  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2158  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  29.63 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000610229  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6453  RelB antitoxin  29.63 
 
 
87 aa  48.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190461  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4297  addiction module antitoxin  29.63 
 
 
87 aa  48.1  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000000082937  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0239  RelB antitoxin family  39.66 
 
 
134 aa  47.8  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0150  hypothetical protein  47.06 
 
 
103 aa  47  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000721335  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2867  addiction module antitoxin  29.27 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.041013  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3445  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  40.43 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4157  hypothetical protein  41.82 
 
 
176 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3887  DNA-damage-inducible protein J  31.75 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0238  addiction module antitoxin component DinJ  32.81 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00225  hypothetical protein  32.26 
 
 
86 aa  42.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0270  addiction module antitoxin component DinJ  32.26 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.686864 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3394  addiction module antitoxin  32.26 
 
 
86 aa  42.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1061  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  38.71 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142992 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00221  predicted antitoxin of YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  32.26 
 
 
86 aa  42.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0259  addiction module antitoxin  32.26 
 
 
86 aa  42.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0254  addiction module antitoxin  32.26 
 
 
86 aa  42.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3381  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  32.26 
 
 
86 aa  42.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3782  DNA-damage-inducible protein  31.25 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11400  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  28.05 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3344  addiction module antitoxin  27.71 
 
 
109 aa  42  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0218664  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0506  DNA-damage-inducible protein J, putative  32.14 
 
 
90 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0548  putative RelB antitoxin  28.57 
 
 
92 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.483871  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3825  DNA-damage-inducible protein J  30.16 
 
 
86 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4999  addiction module antitoxin  29.23 
 
 
86 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1074  putative DNA-damage-inducibile protein  29.07 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0833  DNA-damage-inducible protein J  30 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.407516 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1831  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  34.33 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0365  RelB antitoxin  35.56 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.869677 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>