53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0518 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0518  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  100 
 
 		 98 aa  201  3e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00235093 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0150  hypothetical protein  49.48 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000721335  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3445  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  46.39 
 
 		 101 aa  97.1  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1183  hypothetical protein  44.9 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.291195  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0747  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  46.81 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000814382 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2025  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  44.93 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00570451  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2575  addiction module antitoxin  50.94 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167878 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3187  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  37.8 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1377  RelB antitoxin  39.02 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0852734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11400  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  47.46 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1074  putative DNA-damage-inducibile protein  36.25 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1831  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  39.39 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1714  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  37.31 
 
 		 93 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4201  RelB antitoxin  36.14 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1749  RelB antitoxin  39.39 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00498154  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1084  hypothetical protein  40 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0506  DNA-damage-inducible protein J, putative  37.5 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1573  DNA-damage-inducible protein J, putative  42.86 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0246869  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0302  hypothetical protein  41.67 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.342642  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0393  hypothetical protein  37.25 
 
 		 93 aa  50.1  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00921245  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0414  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  30.77 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1496  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  45.28 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0511  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  45.24 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928195 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3767  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  33.71 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0577  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  38.98 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0548  putative RelB antitoxin  36.99 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.483871  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4452  addiction module antitoxin  41.18 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128999  hitchhiker  0.00983141 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2034  RelB antitoxin  42.86 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4759  addiction module antitoxin  35.14 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.262133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4839  addiction module antitoxin  38.3 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3887  DNA-damage-inducible protein J  31.58 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0507  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  37.25 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.038501 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1524  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  32.91 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.376806  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3825  DNA-damage-inducible protein J  31.58 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0435  DNA-damage-inducible protein J, putative  39.58 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0978363  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3573  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  41.51 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00225  hypothetical protein  30.93 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3381  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  30.93 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0270  addiction module antitoxin component DinJ  30.93 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.686864 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0238  addiction module antitoxin component DinJ  32.63 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3394  addiction module antitoxin  30.93 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0259  addiction module antitoxin  30.93 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0254  addiction module antitoxin  30.93 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00221  predicted antitoxin of YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  30.93 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5830  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  41.67 
 
 		 98 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0393  DNA-damage-inducible protein J  38.1 
 
 		 114 aa  42  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000027091 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1061  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  40.91 
 
 		 108 aa  42  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0833  DNA-damage-inducible protein J  36.36 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.407516 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0663  hypothetical protein  34.78 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4157  hypothetical protein  30.16 
 
 		 176 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1163  addiction module antitoxin  32 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0379  DNA-damage-inducible protein J, putative  32.69 
 
 		 64 aa  40.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1068  addiction module antitoxin  34.04 
 
 		 84 aa  40  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0145416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>