68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2034 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2034  RelB antitoxin  100 
 
 
91 aa  185  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0983  RelB antitoxin  74.65 
 
 
90 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1163  addiction module antitoxin  49.45 
 
 
87 aa  84  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6453  RelB antitoxin  47.25 
 
 
87 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190461  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2158  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  47.25 
 
 
87 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000610229  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4297  addiction module antitoxin  47.25 
 
 
87 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000000082937  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3908  addiction module antitoxin  48.35 
 
 
87 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339882  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2867  addiction module antitoxin  44.94 
 
 
87 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.041013  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0833  DNA-damage-inducible protein J  41.86 
 
 
87 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.407516 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3782  DNA-damage-inducible protein  52.24 
 
 
86 aa  70.5  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2503  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  48.35 
 
 
87 aa  70.1  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4452  addiction module antitoxin  67.35 
 
 
63 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128999  hitchhiker  0.00983141 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4380  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  46.43 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4999  addiction module antitoxin  42.05 
 
 
86 aa  65.5  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3887  DNA-damage-inducible protein J  43.18 
 
 
86 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3825  DNA-damage-inducible protein J  43.68 
 
 
86 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0254  addiction module antitoxin  40.23 
 
 
86 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0259  addiction module antitoxin  40.23 
 
 
86 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3394  addiction module antitoxin  40.23 
 
 
86 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0238  addiction module antitoxin component DinJ  40.91 
 
 
86 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0270  addiction module antitoxin component DinJ  40.23 
 
 
86 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.686864 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36920  RelB antitoxin  45.05 
 
 
86 aa  63.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00225  hypothetical protein  40.23 
 
 
86 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00221  predicted antitoxin of YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  40.23 
 
 
86 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3381  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  40.23 
 
 
86 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0379  DNA-damage-inducible protein J, putative  58.33 
 
 
64 aa  61.6  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5118  addiction module antitoxin  42.35 
 
 
88 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.659791  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1299  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  40 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000279332  hitchhiker  0.000000000509211 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1589  DNA-damage-inducible protein J  40 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0499234  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1922  RelB antitoxin  44.58 
 
 
88 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.119991  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2575  addiction module antitoxin  33.33 
 
 
95 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.167878 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3344  addiction module antitoxin  36.26 
 
 
109 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0218664  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0222  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  30.34 
 
 
93 aa  54.7  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.654292  normal  0.738473 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1496  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  37.97 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1074  putative DNA-damage-inducibile protein  34.44 
 
 
89 aa  53.9  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1874  addiction module antitoxin  43.84 
 
 
85 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  0.190999 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3187  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  30.43 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  50 
 
 
100 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1377  RelB antitoxin  31.4 
 
 
94 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0852734  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1749  RelB antitoxin  39.71 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00498154  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3767  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  38.81 
 
 
90 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0747  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  40.82 
 
 
104 aa  50.4  0.000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000814382 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1714  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  32.22 
 
 
93 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3573  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  34.29 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8393  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  46.94 
 
 
102 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7897  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  46.94 
 
 
102 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373381  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4666  RelB antitoxin  44.9 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0384532  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2090  RelB antitoxin  46.94 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406192  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4201  RelB antitoxin  36.76 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0518  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  42.86 
 
 
98 aa  45.4  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00235093 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2863  addiction module antitoxin  39.29 
 
 
87 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421266  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3232  addiction module antitoxin  44.9 
 
 
102 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0302  hypothetical protein  26.44 
 
 
92 aa  43.9  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.342642  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3758  addiction module antitoxin  40.43 
 
 
99 aa  43.5  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0414  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  28.57 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1831  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  28.4 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3591  addiction module antitoxin  40.43 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5830  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  41.67 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1207  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  34.43 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0150  hypothetical protein  38.78 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000721335  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11400  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  36.23 
 
 
92 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0622  addiction module antitoxin  39.58 
 
 
97 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3445  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  36.73 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1223  addiction module antitoxin  38.3 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.528862  normal  0.677479 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4999  addiction module antitoxin  40.43 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0357  DNA-damage-inducible protein J  31.71 
 
 
85 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2226  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  32.79 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0088475  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2510  RelB antitoxin  40.82 
 
 
66 aa  40  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.400211  normal  0.98229 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>