66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3445 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3445  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  100 
 
 
101 aa  204  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0150  hypothetical protein  57 
 
 
103 aa  124  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000721335  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0518  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  46.39 
 
 
98 aa  97.1  7e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00235093 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1183  hypothetical protein  45.36 
 
 
101 aa  93.2  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.291195  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0747  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  39.42 
 
 
104 aa  92.4  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000814382 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1377  RelB antitoxin  41.49 
 
 
94 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0852734  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2575  addiction module antitoxin  52.73 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.167878 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4201  RelB antitoxin  51.92 
 
 
121 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1074  putative DNA-damage-inducibile protein  34.15 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2025  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  42.86 
 
 
87 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00570451  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11400  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  35.06 
 
 
92 aa  57  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3187  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  47.17 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1496  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  39.34 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1068  addiction module antitoxin  38.75 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0145416  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1831  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  41.82 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1714  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  45.28 
 
 
93 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0507  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  47.06 
 
 
89 aa  55.1  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.038501 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0506  DNA-damage-inducible protein J, putative  36.67 
 
 
90 aa  53.9  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3767  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  44.44 
 
 
90 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0393  hypothetical protein  39.22 
 
 
93 aa  50.8  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00921245  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1061  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  42 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0435  DNA-damage-inducible protein J, putative  33.73 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0978363  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0414  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  38.18 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0511  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  41.51 
 
 
92 aa  48.9  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928195 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0663  hypothetical protein  33.33 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1299  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  25.77 
 
 
89 aa  47.4  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000279332  hitchhiker  0.000000000509211 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1589  DNA-damage-inducible protein J  25.77 
 
 
89 aa  47.4  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0499234  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1524  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  43.48 
 
 
87 aa  47  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.376806  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4452  addiction module antitoxin  37.25 
 
 
63 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128999  hitchhiker  0.00983141 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0302  hypothetical protein  36.92 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.342642  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1084  hypothetical protein  40.43 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1749  RelB antitoxin  36.73 
 
 
110 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00498154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4839  addiction module antitoxin  41.86 
 
 
98 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605483  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0721  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  42.31 
 
 
83 aa  46.2  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1573  DNA-damage-inducible protein J, putative  34.69 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0246869  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1223  addiction module antitoxin  28.42 
 
 
101 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.528862  normal  0.677479 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0577  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  28.85 
 
 
96 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2090  RelB antitoxin  31.08 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406192  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3908  addiction module antitoxin  39.62 
 
 
87 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339882  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3887  DNA-damage-inducible protein J  29.09 
 
 
86 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1163  addiction module antitoxin  33.33 
 
 
87 aa  43.5  0.0009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4759  addiction module antitoxin  25.56 
 
 
165 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.262133  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0393  DNA-damage-inducible protein J  30.95 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000027091 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1047  DNA-damage-inducible protein J  28.57 
 
 
94 aa  42.7  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532229  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  27.17 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5118  addiction module antitoxin  25.84 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.659791  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3782  DNA-damage-inducible protein  35.09 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3825  DNA-damage-inducible protein J  29.09 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2867  addiction module antitoxin  27.96 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.041013  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4999  addiction module antitoxin  32.73 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2606  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  32 
 
 
89 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.680421  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4380  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  37.25 
 
 
95 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0738  hypothetical protein  29.63 
 
 
86 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000842316  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2034  RelB antitoxin  36.73 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2863  addiction module antitoxin  35.42 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421266  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0259  addiction module antitoxin  30.91 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3573  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  37.74 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00221  predicted antitoxin of YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  30.91 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00225  hypothetical protein  30.91 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0254  addiction module antitoxin  30.91 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3394  addiction module antitoxin  30.91 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0270  addiction module antitoxin component DinJ  30.91 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.686864 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3381  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  30.91 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0238  addiction module antitoxin component DinJ  30.91 
 
 
86 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0833  DNA-damage-inducible protein J  26 
 
 
87 aa  40.8  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.407516 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0379  DNA-damage-inducible protein J, putative  28.3 
 
 
64 aa  40  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>