35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1047 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1047  DNA-damage-inducible protein J  100 
 
 		 94 aa  196  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0302  hypothetical protein  30.34 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.342642  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0833  DNA-damage-inducible protein J  28.89 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.407516 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0393  hypothetical protein  32.56 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00921245  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0435  DNA-damage-inducible protein J, putative  38.89 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0978363  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3908  addiction module antitoxin  32.18 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339882  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1074  putative DNA-damage-inducibile protein  34.78 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3825  DNA-damage-inducible protein J  32.94 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2867  addiction module antitoxin  28.89 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.041013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3887  DNA-damage-inducible protein J  32.94 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3381  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  32.14 
 
 		 86 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0414  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  38.46 
 
 		 92 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0238  addiction module antitoxin component DinJ  33.33 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3394  addiction module antitoxin  32.14 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00221  predicted antitoxin of YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  32.14 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0259  addiction module antitoxin  32.14 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0254  addiction module antitoxin  32.14 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0270  addiction module antitoxin component DinJ  32.14 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.686864 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0969  RelB protein  31.25 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00225  hypothetical protein  32.14 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3445  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  28.57 
 
 		 101 aa  42.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1068  addiction module antitoxin  31.25 
 
 		 84 aa  42  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0145416  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1163  addiction module antitoxin  29.07 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1183  hypothetical protein  28.57 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.291195  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3187  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  35.42 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5830  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  39.58 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0379  DNA-damage-inducible protein J, putative  33.33 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2503  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  29.21 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3767  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  27.78 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2025  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  28.38 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00570451  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0150  hypothetical protein  26.67 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000721335  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1524  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  34.04 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.376806  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4999  addiction module antitoxin  38.46 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2510  RelB antitoxin  39.58 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.400211  normal  0.98229 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  40 
 
 		 100 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>