49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2226 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2226  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  100 
 
 		 79 aa  156  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0088475  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5388  stability cassette protein, putative  73.42 
 
 		 79 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4396  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  70 
 
 		 80 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  0.921307 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4646  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  70 
 
 		 80 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4468  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  70 
 
 		 80 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.791173  normal  0.577271 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4331  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  70 
 
 		 80 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2071  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  65.82 
 
 		 79 aa  110  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4262  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  65.82 
 
 		 79 aa  110  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4226  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  65.82 
 
 		 79 aa  110  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2078  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  65.82 
 
 		 79 aa  110  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0200075  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1207  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  64.56 
 
 		 79 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0017  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  64.56 
 
 		 79 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1995  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  61.25 
 
 		 80 aa  99.4  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4700  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  51.25 
 
 		 80 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.85974 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4795  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  51.25 
 
 		 80 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4829  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  51.25 
 
 		 80 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4850  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  51.25 
 
 		 80 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0434  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  50 
 
 		 80 aa  89  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4715  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  48.75 
 
 		 80 aa  89  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1072  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  47.5 
 
 		 87 aa  72  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.949266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1757  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  47.89 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.85675 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0969  RelB protein  33.33 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4268  hypothetical protein  52 
 
 		 50 aa  54.7  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4380  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  39.47 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2510  RelB antitoxin  44.19 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.400211  normal  0.98229 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5830  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  38.57 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  40.28 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4666  RelB antitoxin  40.58 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0384532  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2090  RelB antitoxin  42.86 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406192  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7897  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  39.13 
 
 		 102 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373381  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8393  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  39.13 
 
 		 102 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3782  DNA-damage-inducible protein  36.84 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0365  RelB antitoxin  32.08 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.869677 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1183  RelB antitoxin  37.5 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.642171 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3887  DNA-damage-inducible protein J  48.84 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3908  addiction module antitoxin  34.21 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339882  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0270  addiction module antitoxin component DinJ  48.84 
 
 		 86 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.686864 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0238  addiction module antitoxin component DinJ  48.84 
 
 		 86 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3394  addiction module antitoxin  48.84 
 
 		 86 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0259  addiction module antitoxin  48.84 
 
 		 86 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0254  addiction module antitoxin  48.84 
 
 		 86 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00225  hypothetical protein  48.84 
 
 		 86 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3381  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  48.84 
 
 		 86 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00221  predicted antitoxin of YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  48.84 
 
 		 86 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36920  RelB antitoxin  40.91 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3758  addiction module antitoxin  36.99 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0129  hypothetical protein  32.05 
 
 		 280 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436731  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3825  DNA-damage-inducible protein J  46.51 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2034  RelB antitoxin  32.79 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>