43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2071 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009425  Ent638_4262  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  100 
 
 		 79 aa  156  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2071  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  100 
 
 		 79 aa  156  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2078  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  100 
 
 		 79 aa  156  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0200075  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4226  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  100 
 
 		 79 aa  156  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0017  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  98.73 
 
 		 79 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2226  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  65.82 
 
 		 79 aa  110  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0088475  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4396  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  61.25 
 
 		 80 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  0.921307 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4646  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  61.25 
 
 		 80 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4468  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  61.25 
 
 		 80 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.791173  normal  0.577271 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4331  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  61.25 
 
 		 80 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5388  stability cassette protein, putative  56.96 
 
 		 79 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1995  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  58.75 
 
 		 80 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1207  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  50.63 
 
 		 79 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4829  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  46.25 
 
 		 80 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4795  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  46.25 
 
 		 80 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4850  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  46.25 
 
 		 80 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4700  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  46.25 
 
 		 80 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.85974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4715  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  47.5 
 
 		 80 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0434  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  43.75 
 
 		 80 aa  80.5  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4268  hypothetical protein  77.55 
 
 		 50 aa  75.9  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1072  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  46.25 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.949266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1757  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  46.25 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.85675 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0969  RelB protein  28.57 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2510  RelB antitoxin  41.46 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.400211  normal  0.98229 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5830  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  35.71 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1299  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  46.51 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000279332  hitchhiker  0.000000000509211 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1589  DNA-damage-inducible protein J  46.51 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0499234  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3782  DNA-damage-inducible protein  39.47 
 
 		 86 aa  44.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  38.57 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2158  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  34.21 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000610229  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5118  addiction module antitoxin  48.84 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.659791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4297  addiction module antitoxin  32.89 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000000082937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1922  RelB antitoxin  46.51 
 
 		 88 aa  42.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.119991  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6453  RelB antitoxin  32.89 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190461  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1496  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  35.48 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36920  RelB antitoxin  43.18 
 
 		 86 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3758  addiction module antitoxin  34.29 
 
 		 99 aa  41.2  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2867  addiction module antitoxin  41.86 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.041013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2090  RelB antitoxin  44.23 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406192  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2770  RelB antitoxin  44.44 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1223  addiction module antitoxin  33.8 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.528862  normal  0.677479 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0365  RelB antitoxin  32.69 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.869677 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3591  addiction module antitoxin  35.71 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>