33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1995 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1995  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  100 
 
 		 80 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4646  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  87.5 
 
 		 80 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4468  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  87.5 
 
 		 80 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.791173  normal  0.577271 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4331  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  87.5 
 
 		 80 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4396  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  87.5 
 
 		 80 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  0.921307 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2226  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  61.25 
 
 		 79 aa  99.4  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0088475  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5388  stability cassette protein, putative  60 
 
 		 79 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1207  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  56.25 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2078  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  58.75 
 
 		 79 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0200075  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2071  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  58.75 
 
 		 79 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4226  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  58.75 
 
 		 79 aa  91.7  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4262  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  58.75 
 
 		 79 aa  91.7  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0017  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  58.75 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4829  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  51.25 
 
 		 80 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4700  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  51.25 
 
 		 80 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.85974 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4795  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  51.25 
 
 		 80 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4850  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  51.25 
 
 		 80 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0434  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  50 
 
 		 80 aa  87.4  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4715  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  45 
 
 		 80 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1072  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  38.75 
 
 		 87 aa  51.6  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.949266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1757  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  41.79 
 
 		 87 aa  50.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.85675 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2510  RelB antitoxin  46.34 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.400211  normal  0.98229 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3782  DNA-damage-inducible protein  37.66 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2770  RelB antitoxin  44.44 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1163  addiction module antitoxin  34.15 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3908  addiction module antitoxin  35.71 
 
 		 87 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339882  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4380  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  35.06 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0969  RelB protein  34.88 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0129  hypothetical protein  41.3 
 
 		 280 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436731  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2158  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  36.23 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000610229  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4297  addiction module antitoxin  36.23 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000000082937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2090  RelB antitoxin  46.51 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406192  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6453  RelB antitoxin  36.23 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>