35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0357 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0357  DNA-damage-inducible protein J  100 
 
 		 85 aa  167  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0425  RelB antitoxin  100 
 
 		 67 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1236  DNA-damage-inducible protein J  100 
 
 		 67 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112561 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2503  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  42.17 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00221  predicted antitoxin of YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  36.25 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00225  hypothetical protein  36.25 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0270  addiction module antitoxin component DinJ  36.25 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.686864 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3394  addiction module antitoxin  36.25 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0259  addiction module antitoxin  36.25 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0254  addiction module antitoxin  36.25 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3381  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  35 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0238  addiction module antitoxin component DinJ  34.15 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1589  DNA-damage-inducible protein J  39.02 
 
 		 89 aa  50.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0499234  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1299  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  39.02 
 
 		 89 aa  50.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000279332  hitchhiker  0.000000000509211 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3908  addiction module antitoxin  37.8 
 
 		 87 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339882  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1496  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  33.33 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3344  addiction module antitoxin  41.77 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0218664  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5118  addiction module antitoxin  39.02 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.659791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1163  addiction module antitoxin  37.04 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4999  addiction module antitoxin  34.57 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1874  addiction module antitoxin  39.02 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  0.190999 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0833  DNA-damage-inducible protein J  34.52 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.407516 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3825  DNA-damage-inducible protein J  33.75 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3887  DNA-damage-inducible protein J  33.75 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4380  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  37.88 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2158  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  34.18 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000610229  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2575  addiction module antitoxin  30.38 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167878 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2867  addiction module antitoxin  36.51 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.041013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1922  RelB antitoxin  40 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.119991  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3782  DNA-damage-inducible protein  33.75 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2034  RelB antitoxin  31.71 
 
 		 91 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1377  RelB antitoxin  33.87 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0852734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4297  addiction module antitoxin  31.65 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000000082937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6453  RelB antitoxin  31.65 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190461  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36920  RelB antitoxin  33.33 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>