89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4291 on replicon NC_008766
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1542  alkanesulfonate monooxygenase  92.15 
 
 
1164 bp  815    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.396706  normal  0.848175 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4291    100 
 
 
750 bp  1487    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0560  alkanesulfonate monooxygenase  79.32 
 
 
1215 bp  202  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43870  Alkanesulfonate monooxygenase  79.3 
 
 
1134 bp  170  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1771  alkanesulfonate monooxygenase  80.39 
 
 
1155 bp  153  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1866  alkanesulfonate monooxygenase  86.96 
 
 
1176 bp  131  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  89.42 
 
 
1149 bp  119  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3247  alkanesulfonate monooxygenase  86.84 
 
 
1140 bp  107  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0369402  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5413  alkanesulfonate monooxygenase  85.38 
 
 
1149 bp  107  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592589  hitchhiker  0.0021223 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  82.72 
 
 
1164 bp  99.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  82.72 
 
 
1164 bp  99.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0682  alkanesulfonate monooxygenase  84.21 
 
 
1191 bp  97.6  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.628755 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2883  alkanesulfonate monooxygenase  84.38 
 
 
1176 bp  95.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.834622  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  86.54 
 
 
1176 bp  95.6  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1976  alkanesulfonate monooxygenase  90.67 
 
 
1164 bp  93.7  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  90.54 
 
 
1164 bp  91.7  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  88.89 
 
 
1161 bp  89.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  94.64 
 
 
1161 bp  87.7  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  93.33 
 
 
1158 bp  87.7  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2501  alkanesulfonate monooxygenase  93.22 
 
 
1431 bp  85.7  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  90.91 
 
 
1146 bp  83.8  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  92.98 
 
 
1158 bp  81.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1683  alkanesulfonate monooxygenase  83.2 
 
 
1149 bp  81.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1213  alkanesulfonate monooxygenase  85.57 
 
 
1209 bp  81.8  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428765  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  92.98 
 
 
1158 bp  81.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1744  alkanesulfonate monooxygenase  86.52 
 
 
1161 bp  81.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  89.04 
 
 
1182 bp  81.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  83.62 
 
 
1146 bp  79.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2418  alkanesulfonate monooxygenase  89.71 
 
 
1164 bp  79.8  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.937223  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1082  alkanesulfonate monooxygenase  91.67 
 
 
1158 bp  79.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1562  alkanesulfonate monooxygenase  91.67 
 
 
1158 bp  79.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.672948  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  83.62 
 
 
1146 bp  79.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1670  alkanesulfonate monooxygenase  91.67 
 
 
1158 bp  79.8  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1538  alkanesulfonate monooxygenase  91.67 
 
 
1158 bp  79.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111303  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  91.67 
 
 
1188 bp  79.8  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  94.12 
 
 
1176 bp  77.8  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1836  alkanesulfonate monooxygenase  91.53 
 
 
1158 bp  77.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2976  alkanesulfonate monooxygenase  91.53 
 
 
1170 bp  77.8  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0779  alkanesulfonate monooxygenase  91.53 
 
 
1158 bp  77.8  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0825732  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1989  alkanesulfonate monooxygenase  91.53 
 
 
1512 bp  77.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17879  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1821  alkanesulfonate monooxygenase  91.53 
 
 
1158 bp  77.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1239  alkanesulfonate monooxygenase  91.53 
 
 
1158 bp  77.8  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401522  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0382  alkanesulfonate monooxygenase  91.53 
 
 
1158 bp  77.8  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427311  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1725  alkanesulfonate monooxygenase  91.53 
 
 
1158 bp  77.8  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19560  alkanesulfonate monooxygenase  82.68 
 
 
1149 bp  77.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  86.05 
 
 
1140 bp  75.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0115  alkanesulfonate monooxygenase oxidoreductase  91.23 
 
 
1200 bp  73.8  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0799771  hitchhiker  0.00306006 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  84.54 
 
 
1149 bp  73.8  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30500  alkanesulfonate monooxygenase  89.06 
 
 
1149 bp  71.9  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  83.65 
 
 
1158 bp  71.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1340  alkanesulfonate monooxygenase  90 
 
 
1176 bp  71.9  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5331  Luciferase-like monooxygenase  90 
 
 
1164 bp  71.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247729  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0770  Alkanesulfonate monooxygenase  83.04 
 
 
1188 bp  71.9  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1777  alkanesulfonate monooxygenase  86.08 
 
 
1185 bp  69.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.300954  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2305  Alkanesulfonate monooxygenase  85.54 
 
 
1188 bp  69.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.302323 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1371  alkanesulfonate monooxygenase  87.32 
 
 
1164 bp  69.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2574  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)-dependent  92 
 
 
1143 bp  67.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  89.47 
 
 
1176 bp  65.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  85 
 
 
1143 bp  63.9  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3456  alkanesulfonate monooxygenase  84.52 
 
 
1188 bp  63.9  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4322  alkanesulfonate monooxygenase  87.5 
 
 
1149 bp  63.9  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.176296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0253  alkanesulfonate monooxygenase  82.83 
 
 
1149 bp  61.9  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393943  normal  0.137201 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4974  alkanesulfonate monooxygenase  88.14 
 
 
1149 bp  61.9  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0541962  hitchhiker  0.00870398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0890  alkanesulfonate monooxygenase  96.97 
 
 
1170 bp  58  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1777  alkanesulfonate monooxygenase  83.53 
 
 
1143 bp  58  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6907  Alkanesulfonate monooxygenase  91.11 
 
 
1143 bp  58  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0896  alkanesulfonate monooxygenase  96.97 
 
 
1170 bp  58  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414425  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0907  alkanesulfonate monooxygenase  96.97 
 
 
1170 bp  58  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1737  alkanesulfonate monooxygenase  81.42 
 
 
1149 bp  58  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44148  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  84.72 
 
 
1164 bp  56  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0262  alkanesulfonate monooxygenase  87.5 
 
 
1149 bp  56  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0238  alkanesulfonate monooxygenase  87.5 
 
 
1149 bp  56  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00946  hypothetical protein  83.13 
 
 
1146 bp  54  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2708  Alkanesulfonate monooxygenase  83.13 
 
 
1146 bp  54  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2070  Alkanesulfonate monooxygenase  96.77 
 
 
1176 bp  54  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1097  alkanesulfonate monooxygenase  83.13 
 
 
1146 bp  54  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0063257  normal  0.316235 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2383    83.13 
 
 
1146 bp  54  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2661  alkanesulfonate monooxygenase  83.13 
 
 
1146 bp  54  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.499815  normal  0.0111176 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1037  alkanesulfonate monooxygenase  83.13 
 
 
1146 bp  54  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1044  alkanesulfonate monooxygenase  83.13 
 
 
1146 bp  54  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00939  alkanesulfonate monooxygenase  83.13 
 
 
1146 bp  54  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185267  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2788  alkanesulfonate monooxygenase  100 
 
 
1149 bp  52  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  90.24 
 
 
1146 bp  50.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1372  Alkanesulfonate monooxygenase  86.79 
 
 
1185 bp  50.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5872  alkanesulfonate monooxygenase  82.89 
 
 
1095 bp  48.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0969875 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4433  alkanesulfonate monooxygenase  82.89 
 
 
1095 bp  48.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911225  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3933  alkanesulfonate monooxygenase  82.89 
 
 
1095 bp  48.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00336425  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0014  glutathione S-transferase-like protein  96.43 
 
 
672 bp  48.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198681  normal  0.0539534 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2225  Alkanesulfonate monooxygenase  90 
 
 
1155 bp  48.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000335476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>