13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4272 on replicon NC_008766
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007337  Reut_D6504  conjugal transfer protein TrbD  100 
 
 		 103 aa  210  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136548  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6633  conjugal transfer protein TrbD  100 
 
 		 103 aa  210  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000138876  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4272  conjugal transfer protein TrbD  100 
 
 		 103 aa  210  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000000000615182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0049  conjugal transfer protein TrbD  69.9 
 
 		 104 aa  154  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.635043  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2227  conjugal transfer protein TrbD  68.93 
 
 		 106 aa  149  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00500311  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5378  conjugal transfer protein TrbD  51.76 
 
 		 98 aa  94.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.832169  normal  0.316362 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5484  conjugal transfer protein TrbD  53.49 
 
 		 99 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8332  conjugal transfer protein TrbD  52.94 
 
 		 99 aa  92.8  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.514686  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9267  conjugal transfer protein TrbD  52.94 
 
 		 99 aa  90.5  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4567  conjugal transfer protein TrbD  51.76 
 
 		 99 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9658  conjugal transfer protein TrbD  43.68 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1618  Conjugal transfer TrbD family protein  36.56 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2502  conjugal transfer TrbD family protein  32.18 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>