10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4320 on replicon NC_008766
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008766  Ajs_4320  conjugal transfer protein  100 
 
 		 130 aa  253  8e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.663774  normal  0.434763 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6522  conjugal transfer protein  56.25 
 
 		 129 aa  131  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.502553  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6615  conjugal transfer protein  56.25 
 
 		 129 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.184542  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2245  conjugal transfer protein  49.07 
 
 		 120 aa  84  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1006  conjugal transfer protein  45.87 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0022  putative conjugal transfer protein TraD  52.05 
 
 		 77 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1116  conjugal transfer protein  46.97 
 
 		 80 aa  63.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.066169  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4667  conjugal transfer protein  48.84 
 
 		 59 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2525  hypothetical protein  37.93 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000544451 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1647  hypothetical protein  53.66 
 
 		 62 aa  40.4  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>