9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6615 on replicon NC_008385
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007337  Reut_D6522  conjugal transfer protein  100 
 
 		 129 aa  252  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.502553  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6615  conjugal transfer protein  100 
 
 		 129 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.184542  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4320  conjugal transfer protein  56.25 
 
 		 130 aa  131  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.663774  normal  0.434763 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2245  conjugal transfer protein  50 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1006  conjugal transfer protein  46.74 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0022  putative conjugal transfer protein TraD  62 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1116  conjugal transfer protein  50.91 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.066169  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3355  resolvase domain-containing protein  60 
 
 		 301 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0978291  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4667  conjugal transfer protein  51.16 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>