8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_A0022 on replicon NC_009704
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009704  YpsIP31758_A0022  putative conjugal transfer protein TraD  100 
 
 		 77 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4320  conjugal transfer protein  52.05 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.663774  normal  0.434763 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2245  conjugal transfer protein  55.22 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6522  conjugal transfer protein  62 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.502553  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6615  conjugal transfer protein  62 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.184542  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1006  conjugal transfer protein  46.38 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1116  conjugal transfer protein  53.06 
 
 		 80 aa  51.6  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.066169  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4667  conjugal transfer protein  48.89 
 
 		 59 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>