643 genes were found for organism Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 7    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CND00010  CDS  NC_006686  1076  2305  +  1230  hypothetical protein  XP_570349  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00020  CDS  NC_006686  3730  6005  +  2276  myo-inositol transporter, putative  XP_570347  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00030  CDS  NC_006686  8330  9074  +  745  maltose O-acetyltransferase, putative  XP_570355  normal  0.110026  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00040  CDS  NC_006686  9444  12501  +  3058  transketolase, putative  XP_570357  normal  0.214798  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00050  CDS  NC_006686  14558  17569  +  3012  conserved hypothetical protein  XP_570675  normal  0.0518448  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00060    NC_006686  15943  17530  -  1588      normal  0.0992807  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00070  CDS  NC_006686  18556  20874  +  2319  myo-inositol transporter, putative  XP_570359  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00080    NC_006686  20980  23295  -  2316      normal  0.704865  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00090  CDS  NC_006686  23846  29354  +  5509  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  XP_570345  normal  0.120947  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00100  CDS  NC_006686  32252  35840  -  3589  conserved hypothetical protein  XP_570360  normal  0.0414562  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00110  CDS  NC_006686  37879  41676  +  3798  ATP-dependent DNA helicase, putative  XP_570343  normal  0.368414  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00120  CDS  NC_006686  41800  44551  -  2752  expressed protein  XP_570358  normal  0.189279  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00130  CDS  NC_006686  45741  48447  +  2707  tRNA (cytosine-5-)-methyltransferase, putative  XP_570361  normal  0.0303135  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00140  CDS  NC_006686  48700  49898  +  1199  GTPase, putative  XP_570363  normal  0.0177882  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00150  CDS  NC_006686  50418  52784  +  2367  ferric-chelate reductase, putative  XP_570365  normal  0.0707362  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00160  CDS  NC_006686  53076  54890  -  1815  adenylate kinase, putative  XP_570341  normal  0.165292  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00170  CDS  NC_006686  55027  56026  +  1000  hypothetical protein  XP_570676  normal  0.251132  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00180  CDS  NC_006686  56601  60794  -  4194  glutamate dehydrogenase, putative  XP_570379  normal  0.481448  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00190  CDS  NC_006686  64209  66191  +  1983  conserved hypothetical protein  XP_570339  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00200  CDS  NC_006686  66303  69128  -  2826  transcription factor, putative  XP_570377  normal  0.624384  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00210  CDS  NC_006686  70055  73801  +  3747  exocyst complex component protein, putative  XP_570367  normal  0.151466  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00220  CDS  NC_006686  74052  75297  -  1246  hypothetical protein  XP_570678  normal  0.130717  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00230  tRNA  NC_006686  75422  75509  -  88  tRNA-Phe    normal  0.130678  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00240  CDS  NC_006686  75862  77990  +  2129  adenosylhomocysteinase, putative  XP_570337  normal  0.672849  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00250  CDS  NC_006686  78187  80269  +  2083  hypothetical protein  XP_570335  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00260  CDS  NC_006686  80833  81737  -  905  calcium-dependent protein serine/threonine phosphatase, putative  XP_570333  normal  0.877349  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00270  tRNA  NC_006686  82130  82234  +  105  tRNA-Val    normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00280  CDS  NC_006686  82633  84459  -  1827  hypothetical protein  XP_570677  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00290  CDS  NC_006686  85410  88926  +  3517  expressed protein  XP_570497  normal  0.73536  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00300  CDS  NC_006686  89050  91481  -  2432  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  XP_570375  normal  0.681189  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00310  CDS  NC_006686  95396  96031  +  636  conserved hypothetical protein  XP_570331  normal  0.0351281  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00320  CDS  NC_006686  96340  97419  -  1080  expressed protein  XP_570372  normal  0.301707  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00330  tRNA  NC_006686  97632  97719  -  88  tRNA-Phe    normal  0.0904206  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00340  CDS  NC_006686  97926  98474  +  549  expressed protein  XP_570369  normal  0.0848802  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00350  CDS  NC_006686  100476  102327  -  1852  low-affinity zinc ion transporter, putative  XP_570392  normal  0.292385  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00360  CDS  NC_006686  105328  106190  -  863  hypothetical protein  XP_570329  normal  0.189833  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00370  CDS  NC_006686  106426  109249  +  2824  transcription factor, putative  XP_570381  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00380  CDS  NC_006686  110372  113011  +  2640  glucosidase, putative  XP_570382  normal  0.416294  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00390  CDS  NC_006686  114802  117109  +  2308  multidrug efflux pump, putative  XP_570327  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00400  CDS  NC_006686  117940  120397  +  2458  hypothetical protein  XP_570325  normal  0.679125  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00410  CDS  NC_006686  120809  122356  -  1548  hypothetical protein  XP_570679  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00420  CDS  NC_006686  122446  124337  +  1892  expressed protein  XP_570383  normal  0.230058  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00430  CDS  NC_006686  124483  125121  -  639  hypothetical protein  XP_570323  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00440  CDS  NC_006686  125326  127806  -  2481  aflatoxin efflux pump AFLT, putative  XP_570321  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00450  CDS  NC_006686  128760  130737  -  1978  MFS transporter, putative  XP_570319  normal  0.454016  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00460  CDS  NC_006686  131389  137950  -  6562  nucleolus protein, putative  XP_570368  normal  0.870046  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00470  CDS  NC_006686  138162  141413  +  3252  expressed protein  XP_570362  normal  0.966337  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00480  CDS  NC_006686  141644  143368  -  1725  protein phosphatase inhibitor, putative  XP_570391  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00490  CDS  NC_006686  144321  147428  +  3108  hypothetical protein  XP_570317  normal  0.780843  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00500  CDS  NC_006686  147915  149025  -  1111  conserved hypothetical protein  XP_570390  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00510  CDS  NC_006686  150106  152390  +  2285  amino acid transporter, putative  XP_570384  normal  0.100955  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00520    NC_006686  154111  155193  -  1083      normal  0.66343  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00530  CDS  NC_006686  154014  156624  +  2611  urea transporter, putative  XP_570315  normal  0.45321  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00540    NC_006686  155550  156511  -  962      normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00550  CDS  NC_006686  157129  159693  -  2565  glucosidase, putative  XP_570389  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00560  CDS  NC_006686  161021  162689  +  1669  hypothetical protein  XP_570458  normal  0.911318  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00570  CDS  NC_006686  162955  165099  -  2145  transcription factor, putative  XP_570313  normal  0.414146  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00580  CDS  NC_006686  165297  167663  -  2367  alkylbase DNA N-glycosylase, putative  XP_570311  normal  0.308073  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00590  tRNA  NC_006686  168188  168283  +  96  tRNA-Glu    normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00600  CDS  NC_006686  169004  171405  +  2402  carboxypeptidase D, putative  XP_570309  normal  0.0283026  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00610  CDS  NC_006686  172118  173348  +  1231  protein-binding protein, putative  XP_570307  normal  0.188766  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00620  CDS  NC_006686  173469  174628  -  1160  glutathione transferase, putative  XP_570305  normal  0.295755  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00630  CDS  NC_006686  175394  177523  +  2130  expressed protein  XP_570364  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00640  CDS  NC_006686  177693  181956  -  4264  membrane protein, putative  XP_570388  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00650  CDS  NC_006686  183049  184356  +  1308  hypothetical protein  XP_570303  normal  0.865213  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00660  CDS  NC_006686  184891  186563  +  1673  glycolipid mannosyltransferase, putative  XP_570302  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00670  CDS  NC_006686  186552  188255  -  1704  guanyl nucleotide binding protein, putative  XP_570385  normal  0.60386  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00680  CDS  NC_006686  188735  193677  +  4943  peptidase, putative  XP_570301  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00690  CDS  NC_006686  193748  194671  -  924  expressed protein  XP_570366  normal  0.535401  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00700  CDS  NC_006686  194900  197320  +  2421  argininosuccinate synthase, putative  XP_570386  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00710  CDS  NC_006686  197492  198092  +  601  protein transporter, putative  XP_570387  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00720  CDS  NC_006686  198738  199757  -  1020  conserved protein  XP_570300  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00730  CDS  NC_006686  200100  200792  +  693  hypothetical protein  XP_570393  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00740  CDS  NC_006686  200879  202625  +  1747  allantoinase, putative  XP_570394  normal  0.260502  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00750  CDS  NC_006686  202694  204456  +  1763  conserved hypothetical protein  XP_570396  normal  0.335958  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00760  CDS  NC_006686  204744  206992  +  2249  lipid particle protein, putative  XP_570371  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00770  CDS  NC_006686  207018  209030  -  2013  expressed protein  XP_570374  normal  0.227725  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00780  CDS  NC_006686  209592  210646  +  1055  expressed protein  XP_570299  normal  0.618981  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00790  CDS  NC_006686  210783  212715  -  1933  glucan 1,3-beta-glucosidase, putative  XP_570338  normal  0.221095  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00800  CDS  NC_006686  213378  217000  -  3623  conserved hypothetical protein  XP_570662  normal  0.123934  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00810  CDS  NC_006686  217520  217813  +  294  hypothetical protein  XP_570336  hitchhiker  0.00626279  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00820  CDS  NC_006686  220379  220960  -  582  hypothetical protein  XP_570334  normal  0.35312  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00830    NC_006686  228723  229800  +  1078      normal  0.200506  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00840    NC_006686  260738  262233  +  1496      normal  0.580022  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00850  CDS  NC_006686  271991  272367  -  377  hypothetical protein  XP_570332  normal  0.63496  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00860  CDS  NC_006686  273717  274135  +  419  hypothetical protein  XP_570330  normal  0.253285  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00870  CDS  NC_006686  274742  276722  +  1981  hypothetical protein  XP_570328  normal  0.0945877  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00880  CDS  NC_006686  276898  277542  +  645  hypothetical protein  XP_570682  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00890  CDS  NC_006686  278419  278860  +  442  hypothetical protein  XP_570326  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00900  CDS  NC_006686  278992  283658  -  4667  pre-mRNA splicing factor, putative  XP_570324  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00910  CDS  NC_006686  283851  285651  +  1801  expressed protein  XP_570322  normal  0.745968  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00920  CDS  NC_006686  286384  286749  +  366  mitochondrion protein, putative  XP_570320  normal  0.747043  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00930  CDS  NC_006686  287725  288340  +  616  hypothetical protein  XP_570318  decreased coverage  0.00736637  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00940  CDS  NC_006686  289133  292035  +  2903  conserved hypothetical protein  XP_570402  normal  0.292242  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00950  CDS  NC_006686  292783  295266  +  2484  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase, putative  XP_570400  normal  0.435109  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00960  CDS  NC_006686  296686  297457  -  772  expressed protein  XP_570316  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00970  CDS  NC_006686  297875  298877  +  1003  conserved hypothetical protein  XP_570683  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00980  CDS  NC_006686  298198  299861  -  1664  conserved hypothetical protein  XP_570690  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND00990  CDS  NC_006686  300071  302766  -  2696  phosphatidate cytidylyltransferase, putative  XP_570424  normal  0.736712  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CND01000  CDS  NC_006686  304264  306765  +  2502  protein-vacuolar targeting protein, putative  XP_570314  normal  0.0201059  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
Page 1 of 7    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7    next >  last >>