22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND00550 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006682  CNM00410  beta-glucan synthesis-associated protein, putative  61.67 
 
 
622 aa  757    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00380  glucosidase, putative  69.95 
 
 
623 aa  859    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00550  glucosidase, putative  100 
 
 
619 aa  1271    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06160  conserved hypothetical protein  57.06 
 
 
588 aa  598  1e-170  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06130  conserved hypothetical protein  57.43 
 
 
599 aa  579  1e-164  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.533369  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10779  putative 1,6-beta-glucan synthetase (Eurofung)  43.23 
 
 
632 aa  398  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75745  glucan synthase subunit involved in cell wall assembly  41.5 
 
 
695 aa  390  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65263  glucan synthase subunit involved in cell wall assembly  41.2 
 
 
653 aa  386  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01640  glucosidase, putative  44.02 
 
 
834 aa  373  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63619  Beta-glucan synthesis-associated protein  40.24 
 
 
482 aa  338  1.9999999999999998e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.463894  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50238  predicted protein  28.51 
 
 
625 aa  155  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48300  predicted protein  26.43 
 
 
746 aa  138  4e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0439212  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56509  predicted protein  26.58 
 
 
669 aa  132  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.917921  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.79 
 
 
1290 aa  49.3  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  31.79 
 
 
281 aa  48.9  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  28.8 
 
 
383 aa  48.5  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.04 
 
 
627 aa  48.1  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  28.81 
 
 
409 aa  47.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  29.27 
 
 
389 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  30.94 
 
 
642 aa  45.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  30.94 
 
 
641 aa  45.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  33.64 
 
 
467 aa  43.9  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>