28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_56509 on replicon NC_011695
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011695  PHATRDRAFT_56509  predicted protein  100 
 
 
669 aa  1398    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.917921  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50238  predicted protein  42.15 
 
 
625 aa  406  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48300  predicted protein  31.75 
 
 
746 aa  310  5.9999999999999995e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0439212  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75745  glucan synthase subunit involved in cell wall assembly  26.85 
 
 
695 aa  145  3e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65263  glucan synthase subunit involved in cell wall assembly  27.85 
 
 
653 aa  139  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_006686  CND06160  conserved hypothetical protein  26.32 
 
 
588 aa  128  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63619  Beta-glucan synthesis-associated protein  27.37 
 
 
482 aa  125  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.463894  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10779  putative 1,6-beta-glucan synthetase (Eurofung)  27.48 
 
 
632 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01640  glucosidase, putative  25.71 
 
 
834 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06130  conserved hypothetical protein  24.74 
 
 
599 aa  119  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.533369  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00550  glucosidase, putative  26.58 
 
 
619 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00380  glucosidase, putative  24.95 
 
 
623 aa  114  5e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00410  beta-glucan synthesis-associated protein, putative  31.95 
 
 
622 aa  107  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  30.07 
 
 
409 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  34.96 
 
 
588 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  30.19 
 
 
279 aa  55.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  31.25 
 
 
383 aa  53.9  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.6 
 
 
819 aa  53.9  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  32.56 
 
 
283 aa  49.7  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  29.38 
 
 
1059 aa  47.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  29.93 
 
 
556 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  35.96 
 
 
1441 aa  47  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  32 
 
 
274 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  28.83 
 
 
1321 aa  45.8  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  35.43 
 
 
291 aa  44.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  26.36 
 
 
389 aa  44.3  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  30.53 
 
 
286 aa  44.3  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.78 
 
 
288 aa  43.9  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>