22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND00200 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND00200  transcription factor, putative  100 
 
 
773 aa  1601    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.624384  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03080  expressed protein  24.83 
 
 
512 aa  91.3  6e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05980  expressed protein  25.33 
 
 
544 aa  63.9  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.476092  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01848  NosA protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1XE59]  34.57 
 
 
675 aa  51.2  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54094  predicted protein  26.58 
 
 
769 aa  48.9  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05533  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  31.25 
 
 
625 aa  47.8  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00684189  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06173  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  28.12 
 
 
772 aa  47.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67467  DNA-binding proteins Bright/BRCAA1/RBP1  35.44 
 
 
502 aa  47  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.088517  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31032  Fungal transcriptional regulatory protein  33.87 
 
 
803 aa  47.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.282349  normal  0.13348 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02070  hypothetical protein  38.98 
 
 
869 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08431  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  35.21 
 
 
589 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62201  putative transcriptional regulator  38.6 
 
 
576 aa  46.2  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0514301 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00330  PRO1 protein, putative  23.66 
 
 
798 aa  45.8  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01402  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  50 
 
 
692 aa  45.8  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000858732  hitchhiker  0.00000000000000641289 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32615  hypothetical protein  47.83 
 
 
302 aa  45.8  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.044191 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64954  zinc-finger transcription factor of the Zn(2)-Cys(6) binuclear cluster domain type  30.85 
 
 
732 aa  45.8  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.221612  normal  0.0839781 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05609  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  45.45 
 
 
629 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.309251  normal  0.133306 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05390  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  34.74 
 
 
706 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05924  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  33.03 
 
 
733 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0146056  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03075  OefCPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ICC3]  34.15 
 
 
637 aa  44.7  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00200  transcriptional activator, putative  34.52 
 
 
653 aa  44.7  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.608184  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_10382  predicted protein  32.18 
 
 
810 aa  44.3  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.012102  normal  0.0536067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>