20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND00670 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND00670  guanyl nucleotide binding protein, putative  100 
 
 		 413 aa  847    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.60386  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02430  conserved hypothetical protein  28.99 
 
 		 430 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.597543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43656  predicted protein  28.73 
 
 		 467 aa  110  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32940  predicted protein  30.85 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.469353 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  26.58 
 
 		 1364 aa  57  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.72 
 
 		 677 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.01 
 
 		 1163 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.49 
 
 		 1557 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  25.49 
 
 		 1523 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01130  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  22.25 
 
 		 947 aa  46.6  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  27.05 
 
 		 1831 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  23.75 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  26.3 
 
 		 1807 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  25.61 
 
 		 652 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  25 
 
 		 1221 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  24.38 
 
 		 1766 aa  43.9  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  31.97 
 
 		 1901 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36142  predicted protein  31.52 
 
 		 320 aa  43.9  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.14 
 
 		 806 aa  43.5  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>