39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND00190 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND00190  conserved hypothetical protein  100 
 
 
574 aa  1171    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03651  WD repeat-containing protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12190)  35.77 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.767704 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30768  predicted protein  33.33 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0972318  normal  0.6342 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.23 
 
 
1363 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  34.21 
 
 
1411 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  27.66 
 
 
1443 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  31.68 
 
 
1188 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  36.97 
 
 
1265 aa  50.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.33 
 
 
1072 aa  50.4  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.33 
 
 
1072 aa  50.4  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.22 
 
 
630 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.66 
 
 
642 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  26.74 
 
 
1334 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  32.88 
 
 
652 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  29.03 
 
 
1399 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  31.82 
 
 
1652 aa  48.5  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.26 
 
 
924 aa  48.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.69 
 
 
1076 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  28.81 
 
 
1211 aa  47.4  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  30.53 
 
 
1188 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49400  predicted protein  30.48 
 
 
341 aa  47.4  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.673572 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_539  predicted protein  26.67 
 
 
719 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.611801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  27.6 
 
 
405 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  29.29 
 
 
1097 aa  46.6  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42443  predicted protein  29.27 
 
 
1095 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0730577  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  23.23 
 
 
1190 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63551  predicted protein  31.58 
 
 
522 aa  46.2  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1354  WD-40 repeat protein  29.82 
 
 
437 aa  45.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0105276  hitchhiker  0.000000574581 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.96 
 
 
1004 aa  45.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  25.76 
 
 
1344 aa  44.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.97 
 
 
1481 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  25.7 
 
 
1831 aa  44.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1045  WD-40 repeat-containing protein  26.4 
 
 
357 aa  44.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  26.73 
 
 
1656 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3190  WD-40 repeat protein  25 
 
 
358 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  27.5 
 
 
608 aa  43.9  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42847  predicted protein  31.25 
 
 
984 aa  43.5  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.451507  normal  0.305439 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.97 
 
 
1686 aa  43.9  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  20.95 
 
 
1262 aa  43.9  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>