10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND00830 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB00970  gag-pol polyprotein, putative  96.9 
 
 
1526 bp  1622    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456464  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05780  gag-pol polyprotein, putative  96.87 
 
 
1593 bp  1766    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0862484  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00830    100 
 
 
1078 bp  2137    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.200506  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03030    96.18 
 
 
7155 bp  1715    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.566664  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03190    96.99 
 
 
4905 bp  1332    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  unclonable  0.000000117128  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03700    100 
 
 
3273 bp  103  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389687  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06340    100 
 
 
177 bp  103  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.393953  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00960  expressed protein  96.15 
 
 
3140 bp  87.7  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.224057  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03050  hypothetical protein  88.46 
 
 
1361 bp  56  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03180  cAMP-dependent protein kinase, putative  91.89 
 
 
2857 bp  50.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0270588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>