46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF03030 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006693  CNH01480    86.17 
 
 
12126 bp  1164    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.363818  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02030    84.36 
 
 
4377 bp  1082    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.346684  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02050    86.09 
 
 
3573 bp  1156    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.250754  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00970  gag-pol polyprotein, putative  95.78 
 
 
1526 bp  2462    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456464  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02950    86.32 
 
 
5775 bp  1179    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0398404  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00530    85.46 
 
 
4734 bp  827    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0903388  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05780  gag-pol polyprotein, putative  95.36 
 
 
1593 bp  2565    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0862484  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04180    84.36 
 
 
7164 bp  1082    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.192446  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00520    85.87 
 
 
4542 bp  781    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285744  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00830    96.18 
 
 
1078 bp  1715    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.200506  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02990    86.19 
 
 
4911 bp  1029    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000623592  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02860    86.4 
 
 
1383 bp  718    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02790    84.55 
 
 
11454 bp  837    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03030    100 
 
 
7155 bp  14180    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.566664  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03060    84.5 
 
 
4713 bp  1098    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710679  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03190    95.29 
 
 
4905 bp  1229    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  unclonable  0.000000117128  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03650    86.67 
 
 
4674 bp  916    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03120    96.92 
 
 
2895 bp  507  1e-140  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03620    88.6 
 
 
1755 bp  410  1e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124458  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00510    88.66 
 
 
5559 bp  387  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748048  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03690    90.94 
 
 
7809 bp  327  3e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02000    89.42 
 
 
5844 bp  311  2.0000000000000002e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01450    94.12 
 
 
3186 bp  309  6.000000000000001e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06340    96.57 
 
 
177 bp  291  1.0000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.393953  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00510    88.49 
 
 
3126 bp  289  6.000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0721861  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00960  expressed protein  95.32 
 
 
3140 bp  268  2e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.224057  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03670    83.63 
 
 
1830 bp  268  2e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0490526  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00560    89.22 
 
 
9432 bp  262  1.0000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02940    89.22 
 
 
4674 bp  262  1.0000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0953543  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02010    89.22 
 
 
3753 bp  262  1.0000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.788594  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02930    88.36 
 
 
5061 bp  246  8e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108967  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00500    90.05 
 
 
1650 bp  228  1.9999999999999999e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0152578  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02530  hypothetical protein  84.31 
 
 
1581 bp  188  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.857331  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02630    87.28 
 
 
2534 bp  137  5.0000000000000004e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.250983  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03050  hypothetical protein  88.04 
 
 
1361 bp  87.7  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03180  cAMP-dependent protein kinase, putative  91.67 
 
 
2857 bp  87.7  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0270588  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01490    78 
 
 
12648 bp  83.8  0.0000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03640    82.09 
 
 
6336 bp  75.8  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03000    82.09 
 
 
6462 bp  75.8  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00372907  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02950    82.09 
 
 
3657 bp  75.8  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.565441  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00540    82.09 
 
 
10638 bp  75.8  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271423  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03100    81.34 
 
 
5637 bp  67.9  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764766  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03680    81.34 
 
 
5499 bp  67.9  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01290    78.77 
 
 
2966 bp  63.9  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02970    93.18 
 
 
1904 bp  56  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.99473  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0620  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  96.55 
 
 
1941 bp  50.1  0.009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
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