More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1119 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  756    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  98.38 
 
 
371 aa  750    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.91 
 
 
389 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  36.62 
 
 
389 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  33.53 
 
 
380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  35.05 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5738  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.58 
 
 
447 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.38713 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.38 
 
 
406 aa  160  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  36.08 
 
 
388 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.29 
 
 
385 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4325  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.96 
 
 
405 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248121  normal  0.0483573 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  35.48 
 
 
407 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  36.16 
 
 
385 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5360  twin-arginine translocation pathway signal  30.03 
 
 
447 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5451  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.03 
 
 
447 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  36.13 
 
 
388 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.29 
 
 
385 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  36.13 
 
 
388 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  36.13 
 
 
388 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  36.13 
 
 
388 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  36.13 
 
 
388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  36.05 
 
 
388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4094  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.96 
 
 
405 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  35.29 
 
 
385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4170  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.96 
 
 
405 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  33.24 
 
 
385 aa  156  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  34.97 
 
 
407 aa  155  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.93 
 
 
388 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  30.46 
 
 
740 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  34.08 
 
 
443 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  35.4 
 
 
388 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.67 
 
 
378 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  31.67 
 
 
429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  29.23 
 
 
713 aa  153  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.16 
 
 
413 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.83 
 
 
399 aa  153  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  35.53 
 
 
349 aa  152  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  35.71 
 
 
388 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  35.71 
 
 
388 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.71 
 
 
389 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  35.37 
 
 
388 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.87 
 
 
388 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0375  beta-lactamase  30.72 
 
 
381 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  35.9 
 
 
375 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.83 
 
 
390 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  34.91 
 
 
720 aa  150  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  35.37 
 
 
388 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  33.33 
 
 
431 aa  149  7e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2043  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  37.32 
 
 
421 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956781  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  29.53 
 
 
416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4727  beta-lactamase  32.01 
 
 
366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  33.23 
 
 
370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5142  alkaline D-peptidase  28.57 
 
 
428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00324654  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  28.7 
 
 
467 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.39 
 
 
416 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3468  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.04 
 
 
415 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560934  normal  0.0158413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  33.8 
 
 
374 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  30.18 
 
 
450 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6210  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.91 
 
 
391 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  35.09 
 
 
449 aa  143  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0606  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.87 
 
 
438 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6008  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.42 
 
 
420 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960624  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  31.8 
 
 
392 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6304  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.33 
 
 
420 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397924  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0275  beta-lactamase  31.36 
 
 
400 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.35061  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3339  beta-lactamase  28.86 
 
 
381 aa  136  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2647  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.86 
 
 
429 aa  136  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.180779  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7182  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.94 
 
 
420 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0226696 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4155  beta-lactamase  28.7 
 
 
378 aa  135  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  30.53 
 
 
446 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0435  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  33.68 
 
 
342 aa  134  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  29.33 
 
 
578 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.9 
 
 
392 aa  133  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  33.33 
 
 
406 aa  132  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4691  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.02 
 
 
383 aa  132  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  30.61 
 
 
356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4765  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.68 
 
 
514 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.263187 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3053  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.17 
 
 
420 aa  129  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0398  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.14 
 
 
366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  32.99 
 
 
487 aa  128  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  30.53 
 
 
405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  30.21 
 
 
434 aa  126  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.79 
 
 
414 aa  126  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2416  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.88 
 
 
411 aa  126  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758876  normal  0.129808 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0504  beta-lactamase  29.65 
 
 
409 aa  126  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.35102  hitchhiker  0.00000257291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  31.53 
 
 
848 aa  125  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1771  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.23 
 
 
380 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.1791 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  30.5 
 
 
445 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  29.68 
 
 
389 aa  124  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3281  beta-lactamase  29.43 
 
 
414 aa  123  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.916487  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.9 
 
 
442 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8711  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.7 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0541056  normal  0.0995944 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  30.33 
 
 
476 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3436  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.78 
 
 
381 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4690  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.87 
 
 
379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00394326  normal  0.37742 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15810  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  32.36 
 
 
488 aa  120  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.091319  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2539  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.35 
 
 
445 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  27.87 
 
 
442 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1072  Beta-lactamase  29.01 
 
 
412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2921  beta-lactamase class C-like protein  28.97 
 
 
451 aa  119  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.154271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>