More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2108 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl2108  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  624  1e-178  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2133  hypothetical protein  81.13 
 
 
302 aa  508  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1695  GacS/BarA family sensor protein  42.62 
 
 
125 aa  95.1  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
818 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.14 
 
 
876 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.84 
 
 
763 aa  83.6  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
818 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3808  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
808 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0284545  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3921  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
808 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.799409 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0829  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.79 
 
 
812 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177536 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  35.65 
 
 
578 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1191  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 
124 aa  81.6  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  34.75 
 
 
588 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 
785 aa  79.3  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 
902 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 
631 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6654  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 
829 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000220106 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  31.41 
 
 
1014 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0759  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 
818 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0774  sensor protein  36.92 
 
 
124 aa  77  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1954  PAS/histidine kinase/ATPase domain-containing protein  34.43 
 
 
657 aa  77  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0244  two component system histidine kinase  34.43 
 
 
657 aa  77  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2957  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 
810 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0307  aerobic respiration control sensor protein ArcB  39.5 
 
 
789 aa  75.9  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0739851  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0645  two component system histidine kinase  33.33 
 
 
630 aa  75.5  0.0000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000209128  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0748  putative aerobic respiration control sensor protein arcB  33.33 
 
 
630 aa  75.5  0.0000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000795042  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0835  two component system histidine kinase  27.19 
 
 
831 aa  75.1  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1160  putative sensor protein gacS  27.19 
 
 
808 aa  75.1  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1187  two component system histidine kinase  35.9 
 
 
683 aa  75.5  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.572633  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0844  PAS/histidine kinase/ATPase domain-containing protein  35.9 
 
 
669 aa  75.5  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.644717  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0301  aerobic respiration control sensor protein ArcB  39.5 
 
 
789 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0737861  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.57 
 
 
601 aa  74.7  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  39.62 
 
 
929 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06870  hybrid histidine protein kinase RetS  31.45 
 
 
933 aa  73.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.577631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1723  response regulator receiver and Hpt phospho transfer protein  31.09 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.21 
 
 
817 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3604  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.2 
 
 
1172 aa  73.6  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.29 
 
 
933 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.95 
 
 
962 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3369  response regulator receiver protein  35.19 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0278306 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1879  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.89 
 
 
604 aa  72.4  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3519  aerobic respiration control sensor protein ArcB  36.8 
 
 
778 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3521  aerobic respiration control sensor protein ArcB  36.8 
 
 
778 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3688  aerobic respiration control sensor protein ArcB  36.8 
 
 
778 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.739542  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.2 
 
 
816 aa  72  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2132  hypothetical protein  33.06 
 
 
827 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3626  aerobic respiration control sensor protein ArcB  36.8 
 
 
778 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10996  normal  0.809738 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  25.63 
 
 
847 aa  71.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  31.45 
 
 
882 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0611  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 
925 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62789  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3590  aerobic respiration control sensor protein ArcB  36.8 
 
 
778 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.571349  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3789  aerobic respiration control sensor protein ArcB  36.67 
 
 
779 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00874982  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03075  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ArcA  36 
 
 
778 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0497  multi-sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 
778 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3698  aerobic respiration control sensor protein ArcB  36 
 
 
778 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3403  aerobic respiration control sensor protein ArcB  36 
 
 
778 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0490  aerobic respiration control sensor protein ArcB  36 
 
 
778 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
863 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  36 
 
 
778 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03026  hypothetical protein  36 
 
 
778 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3560  aerobic respiration control sensor protein ArcB  36 
 
 
778 aa  70.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3506  aerobic respiration control sensor protein ArcB  36 
 
 
778 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.648174  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.1 
 
 
937 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6655  histidine kinase  33.1 
 
 
688 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.404692  hitchhiker  0.00000625165 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3631  aerobic respiration control sensor protein ArcB  38.84 
 
 
779 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330412  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  33.61 
 
 
785 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3645  aerobic respiration control sensor protein ArcB  37.5 
 
 
777 aa  70.5  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0208563  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.87 
 
 
941 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  33.61 
 
 
785 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2895  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 
1324 aa  70.1  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000343468  normal  0.0609683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  34.45 
 
 
785 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  30.08 
 
 
1200 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07945  Histidine kinase G2 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ26]  31.88 
 
 
659 aa  69.3  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.708114  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2107  hypothetical protein  32 
 
 
676 aa  69.3  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.79 
 
 
937 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1126  aerobic respiration control sensor protein ArcB  38.33 
 
 
778 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 
1498 aa  68.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4342  aerobic respiration control sensor protein ArcB  36.67 
 
 
779 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  38.33 
 
 
778 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0807351  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64230  RetS (regulator of exopolysaccharide and Type III secretion)  30.65 
 
 
942 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0403381  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0469  aerobic respiration control sensor protein ArcB  38.33 
 
 
778 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.55831  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 
1480 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
932 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4868  sensor histidine kinase/response regulator RetS  29.84 
 
 
929 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3291  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.17 
 
 
933 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59315  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5576  sensor/response regulator hybrid  30.65 
 
 
962 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.37 
 
 
1499 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0706  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 
928 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357941  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  32.82 
 
 
727 aa  67.8  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.97 
 
 
947 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.08 
 
 
653 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0107  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
774 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  30.08 
 
 
1871 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4408  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:histidine kinase:histidine kinase  30.15 
 
 
929 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 
782 aa  67.4  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03837  Signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 
623 aa  67.4  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3046  two-component sensor histidine kinase  27.45 
 
 
515 aa  67  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3846  normal  0.30289 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 
1202 aa  67.4  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3343  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
800 aa  67.4  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.339102  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2532  histidine kinase  33.33 
 
 
399 aa  67  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0679268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>