56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1926 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl1926  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  561  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1403  hypothetical protein  27.71 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02316  transcription regulator protein  31.45 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.499262 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2098  hypothetical protein  34.21 
 
 		 154 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4359  regulatory protein, LuxR  36 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1927  hypothetical protein  46.43 
 
 		 223 aa  53.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0441  regulatory protein LuxR  40.68 
 
 		 286 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.923746  normal  0.0183899 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0440  regulatory protein LuxR  40 
 
 		 246 aa  49.3  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0539143 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0918  transcriptional regulator LuxR family  42.11 
 
 		 230 aa  48.9  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0505  transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0548  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1649  transcriptional regulator RhlR  31.63 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.458186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19120  transcriptional regulator RhlR  31.63 
 
 		 241 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.420854  normal  0.170234 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1558  response regulator receiver  36.51 
 
 		 221 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  31.65 
 
 		 307 aa  46.2  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2601  regulatory protein LuxR  40.35 
 
 		 247 aa  46.2  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5323  transcriptional regulator two component heavy metal regulatory response ZniR  46 
 
 		 206 aa  45.8  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.844748 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 218 aa  45.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4889  LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 235 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.672367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2525  LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.853805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1549  LuxR transcriptional regulator  36.36 
 
 		 201 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355184  normal  0.152747 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1673  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2943  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0796  LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 82 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.548535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0214  LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 181 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.231548  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4984  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 201 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0145131 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3086  transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 695 aa  43.5  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0949  LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 181 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.359362  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1723  sensory box transcriptional regulator  41.67 
 
 		 181 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1698  PAS  41.67 
 
 		 181 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.361141  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1551  LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 181 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955987  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2609  LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 181 aa  43.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1876  LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 181 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402354  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2528  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 201 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1109  LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 181 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0705073  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4359  transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 302 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4720  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 		 222 aa  43.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.104323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5012  regulatory protein, LuxR  36.67 
 
 		 289 aa  43.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.136049 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 245 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0243  regulatory protein LuxR  37.5 
 
 		 245 aa  42.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.537224 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0318  transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 		 234 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0306  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 248 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.6306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2463  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 423 aa  42.7  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0338  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 248 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.137643 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  38.6 
 
 		 253 aa  42.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0287  transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 		 234 aa  42.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  39.34 
 
 		 213 aa  42.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 242 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3754  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.73 
 
 		 216 aa  42.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00290124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  39.29 
 
 		 216 aa  42  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2084  LuxR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 269 aa  42  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>