39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4487 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4487  TP901 family phage tail tape measure protein  100 
 
 		 666 aa  1314    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108183  normal  0.0686634 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2914  prophage MuMc02, TP901 family tail tape measure protein  32.65 
 
 		 993 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4911  TP901 family phage tail tape measure protein  29.05 
 
 		 814 aa  154  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0750  Phage tail tape measure protein TP901, core region  28.42 
 
 		 950 aa  141  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1857  pyocin R2_PP, tail length determination protein, putative  31.06 
 
 		 814 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3322  Phage tail tape measure protein TP901, core region  26.78 
 
 		 743 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3393  tail tape measure protein  29.18 
 
 		 916 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  28.71 
 
 		 781 aa  118  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  29.44 
 
 		 1314 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365241 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3062  pyocin R2_PP, tail length determination protein, putative  29.87 
 
 		 1089 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0911019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0190  hypothetical protein  30.26 
 
 		 735 aa  92.4  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  25.2 
 
 		 739 aa  90.9  7e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1528  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.26 
 
 		 625 aa  90.5  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0884  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.55 
 
 		 823 aa  86.3  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2337  Phage tail tape measure protein  28.93 
 
 		 599 aa  83.2  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3691  hypothetical protein  27.52 
 
 		 902 aa  80.9  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  24.92 
 
 		 739 aa  79.3  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  24.92 
 
 		 739 aa  79.3  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1557  Phage tail tape measure protein TP901, core region  28.96 
 
 		 722 aa  72  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0138329 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  28.4 
 
 		 784 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0743  hypothetical protein  30 
 
 		 646 aa  63.9  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  27.65 
 
 		 784 aa  63.9  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  20.97 
 
 		 817 aa  63.5  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  27.55 
 
 		 784 aa  63.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1569  phage tail tape measure protein, TP901 family  20.84 
 
 		 825 aa  62.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258062  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  45.31 
 
 		 824 aa  61.2  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0580  tail tape measure protein  23.84 
 
 		 714 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.834112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  22.64 
 
 		 719 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  29.45 
 
 		 887 aa  50.8  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  23.92 
 
 		 550 aa  48.9  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0965  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1070 aa  47.4  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3738  hypothetical protein  23.85 
 
 		 540 aa  47.4  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1449  TP901 family phage tail tape measure protein  21.9 
 
 		 1120 aa  45.8  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  25.52 
 
 		 877 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4475  tail protein  23.53 
 
 		 641 aa  44.3  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323148 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0849  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.36 
 
 		 738 aa  44.3  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000280434  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3865  phage tail protein, putative  25.1 
 
 		 651 aa  44.3  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2253  tail protein  26.47 
 
 		 642 aa  43.9  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725805  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2256  tail protein  26.47 
 
 		 642 aa  44.3  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173389 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>