More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4432 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 
385 aa  760    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  68.73 
 
 
383 aa  527  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  68.46 
 
 
383 aa  519  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  66.31 
 
 
383 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  67.47 
 
 
383 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  66.67 
 
 
383 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2443  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  69.27 
 
 
383 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  61.39 
 
 
383 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3189  putative membrane-associated zinc metalloprotease  60.05 
 
 
392 aa  456  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  60.78 
 
 
386 aa  436  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  60.26 
 
 
386 aa  433  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  60.26 
 
 
386 aa  433  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  59.89 
 
 
386 aa  420  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  59.11 
 
 
386 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  54.42 
 
 
373 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  54.2 
 
 
375 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  53.3 
 
 
377 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3836  membrane-associated zinc metalloprotease  61.05 
 
 
381 aa  397  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3440  membrane-associated zinc metalloprotease  60.16 
 
 
384 aa  391  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.549674 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  54.94 
 
 
374 aa  381  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  50.96 
 
 
379 aa  349  4e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0296  membrane-associated zinc metalloprotease  54.64 
 
 
381 aa  348  9e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1593  peptidase RseP  50.55 
 
 
367 aa  333  4e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2035  putative membrane-associated zinc metalloprotease  48.91 
 
 
379 aa  323  4e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1156  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  48.09 
 
 
379 aa  315  9e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569827  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1113  RIP metalloprotease RseP  47.81 
 
 
379 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  43.47 
 
 
361 aa  285  7e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  43.28 
 
 
377 aa  277  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  42.74 
 
 
373 aa  277  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0366  membrane-associated zinc metalloprotease  42.19 
 
 
367 aa  264  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  38.44 
 
 
372 aa  262  8.999999999999999e-69  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.13 
 
 
355 aa  261  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  36.19 
 
 
380 aa  249  7e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.19 
 
 
380 aa  247  2e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.23 
 
 
366 aa  243  3e-63  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.15 
 
 
367 aa  233  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  41.32 
 
 
356 aa  231  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  38.83 
 
 
369 aa  231  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  39.54 
 
 
354 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.31 
 
 
355 aa  220  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  37.46 
 
 
354 aa  220  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  36.9 
 
 
354 aa  219  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2558  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.8 
 
 
353 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  34.93 
 
 
376 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.95 
 
 
339 aa  212  7e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.71 
 
 
357 aa  210  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  38.06 
 
 
355 aa  210  3e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  36.74 
 
 
347 aa  208  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1367  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.74 
 
 
444 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0141782 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  36.59 
 
 
355 aa  206  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2710  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.3 
 
 
444 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0608503  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  40.95 
 
 
360 aa  204  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.71 
 
 
354 aa  203  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.62 
 
 
347 aa  202  6e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  43.8 
 
 
494 aa  200  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.42 
 
 
368 aa  199  9e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.6 
 
 
368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  34.63 
 
 
355 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  34.34 
 
 
354 aa  193  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.24 
 
 
372 aa  192  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  33.52 
 
 
338 aa  192  8e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.07 
 
 
368 aa  189  8e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0514  membrane-associated zinc metalloprotease  32.89 
 
 
377 aa  189  8e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.30248 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.64 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1444  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.07 
 
 
377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.61 
 
 
343 aa  184  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  33.79 
 
 
353 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3918  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.86 
 
 
418 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1326  RIP metalloprotease RasP  30.86 
 
 
418 aa  179  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000504967 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3561  membrane-associated zinc metalloprotease  31.03 
 
 
420 aa  179  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3579  membrane-associated zinc metalloprotease  31.03 
 
 
420 aa  179  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  33.71 
 
 
352 aa  179  8e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3861  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.03 
 
 
420 aa  179  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3832  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.09 
 
 
418 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.5484300000000005e-61 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  44.84 
 
 
480 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3671  membrane-associated zinc metalloprotease  30.8 
 
 
420 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3958  membrane-associated zinc metalloprotease  30.8 
 
 
420 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0623  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.39 
 
 
368 aa  177  4e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  31.59 
 
 
370 aa  176  6e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  33.96 
 
 
369 aa  176  7e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  34.42 
 
 
396 aa  175  9e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  33.05 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  36.84 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3643  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.39 
 
 
418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2472  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.28 
 
 
418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3867  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.63 
 
 
418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2040  membrane-associated zinc metalloprotease  34.75 
 
 
417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  32.96 
 
 
336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  32.81 
 
 
388 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  32.94 
 
 
348 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0932  membrane-associated zinc metalloprotease  33.33 
 
 
342 aa  160  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.115167  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1653  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.4 
 
 
332 aa  160  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2148  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.38 
 
 
444 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0370  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.7 
 
 
345 aa  158  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  39.04 
 
 
450 aa  155  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1148  membrane-associated zinc metalloprotease  31.89 
 
 
419 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0330483  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0352  peptidase M50  31.35 
 
 
345 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0574  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  39.04 
 
 
417 aa  154  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30609  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  39.04 
 
 
456 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.52 
 
 
457 aa  152  7e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>