266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0500 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0500  putative sugar uptake ABC transporter permease protein  100 
 
 
146 aa  296  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.08 
 
 
299 aa  201  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0255144 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.76 
 
 
311 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.578248 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.99 
 
 
299 aa  195  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.494114 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.14 
 
 
312 aa  179  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908761  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  64.12 
 
 
307 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.642563  decreased coverage  0.0000998416 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.4 
 
 
306 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516891  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.12 
 
 
306 aa  169  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.433095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1260  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60 
 
 
291 aa  169  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.28 
 
 
291 aa  167  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3556  putative ABC transporter permease protein  62.7 
 
 
302 aa  167  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1415  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.94 
 
 
292 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.36 
 
 
308 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.809225  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3122  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  42 
 
 
281 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42 
 
 
281 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42 
 
 
281 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.75 
 
 
281 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150444  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.78 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0008  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.7 
 
 
295 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0549  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpE  35.64 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.01 
 
 
275 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 
275 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0036  sugar ABC transporter, permease protein  36 
 
 
276 aa  58.2  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4119  ABC transporter permease protein  34.34 
 
 
303 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0396939  normal  0.542053 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
286 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0280  ABC transporter, inner membrane subunit  32.73 
 
 
280 aa  56.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.01 
 
 
281 aa  56.2  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.17 
 
 
277 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2548  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.98 
 
 
304 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00362276  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2908  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.98 
 
 
303 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265009  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.69 
 
 
276 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.85 
 
 
311 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.736814  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
306 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
283 aa  53.9  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000390677  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.52 
 
 
270 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14810  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.65 
 
 
305 aa  53.9  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0148237 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.04 
 
 
277 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.59 
 
 
270 aa  53.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
255 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  34.75 
 
 
286 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 
291 aa  52  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.05565  normal  0.793563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
274 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.610741  hitchhiker  0.000350702 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
279 aa  51.6  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.08 
 
 
277 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 
275 aa  51.2  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.9 
 
 
288 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.44 
 
 
277 aa  51.2  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2617  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 
283 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644522  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.01 
 
 
276 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0121396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  31.31 
 
 
292 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0722  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.51 
 
 
291 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0409325  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0704  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.66 
 
 
283 aa  50.1  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.776263  normal  0.468478 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.96 
 
 
283 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.062126  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.96 
 
 
283 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111156  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
286 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.78 
 
 
282 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0697  mannitol ABC transporter, permease protein  37.84 
 
 
285 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
279 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.43 
 
 
282 aa  49.7  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5330  ABC transporter  31.11 
 
 
274 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.11 
 
 
276 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
322 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171707  normal  0.684803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.71 
 
 
286 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2142  transmembrane ABC transporter protein  34.78 
 
 
286 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000847847  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1037  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  37.35 
 
 
288 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5924  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.66 
 
 
283 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.755029  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.61 
 
 
297 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0633  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, permease protein  37.35 
 
 
288 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.416543  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2467  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, permease protein  37.35 
 
 
288 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.688343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0874  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, permease protein  37.35 
 
 
288 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0878  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, permease protein  37.35 
 
 
288 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0081  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, permease protein  37.35 
 
 
288 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0141244  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
288 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0180177  hitchhiker  0.00198196 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  29.2 
 
 
275 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
280 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.14397 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
300 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.385749  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
289 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.13 
 
 
284 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.13 
 
 
284 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0401383  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.82 
 
 
404 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.1795  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.27 
 
 
276 aa  48.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 
285 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686039  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3639  monosaccharide-transporting ATPase  26.56 
 
 
292 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0063  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.27 
 
 
291 aa  47.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 
283 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114445  normal  0.437079 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.07 
 
 
274 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.7 
 
 
275 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.965768  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1924  sugar ABC transporter, permease protein  32.65 
 
 
271 aa  47.8  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444482  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
296 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.07 
 
 
278 aa  47.4  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2438  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.48 
 
 
277 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  hitchhiker  0.00104394 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.07 
 
 
278 aa  47.4  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
285 aa  47  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 
283 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0200189  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.92 
 
 
276 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18605  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.91 
 
 
283 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16619  normal  0.170584 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.81 
 
 
296 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174421 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.35 
 
 
280 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0326071  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0750  sugar ABC transporter, permease protein, putative  33.33 
 
 
275 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.29 
 
 
271 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>