More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4195 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4195  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  662    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1641  hypothetical protein  93.96 
 
 
328 aa  600  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2312  hypothetical protein  68.03 
 
 
330 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258984 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5055  extra-cytoplasmic solute receptor  43.96 
 
 
322 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4497  twin-arginine translocation pathway signal  43.79 
 
 
322 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  41.77 
 
 
348 aa  232  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  43.18 
 
 
332 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6345  hypothetical protein  41.38 
 
 
330 aa  227  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0693  hypothetical protein  40.54 
 
 
320 aa  225  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  42.14 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  41.98 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  42.14 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  40 
 
 
332 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  40.35 
 
 
331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  44.28 
 
 
324 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.91 
 
 
325 aa  219  7e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  38.1 
 
 
329 aa  218  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3165  hypothetical protein  43.02 
 
 
325 aa  218  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.209597  hitchhiker  0.0000237032 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  40.35 
 
 
331 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5147  extra-cytoplasmic solute receptor  39.18 
 
 
320 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.698563  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  40.07 
 
 
336 aa  217  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  38.66 
 
 
324 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  38.05 
 
 
327 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  43.07 
 
 
360 aa  216  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  39.51 
 
 
339 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40.75 
 
 
330 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.66 
 
 
331 aa  215  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  38.83 
 
 
328 aa  215  8e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  44.03 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  42.01 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  44.03 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.38 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.14 
 
 
328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  36.59 
 
 
328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  39.53 
 
 
328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5968  hypothetical protein  40.69 
 
 
344 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  43.66 
 
 
337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  39.13 
 
 
326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  40.93 
 
 
339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  40.36 
 
 
328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  41.18 
 
 
327 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  40.38 
 
 
353 aa  212  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  40.21 
 
 
333 aa  212  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  39.19 
 
 
338 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  40.97 
 
 
331 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  39.04 
 
 
332 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  41.3 
 
 
328 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1898  hypothetical protein  38.1 
 
 
329 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931279  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6149  extra-cytoplasmic solute receptor protein Bug family  41.26 
 
 
339 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.873662 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  40.21 
 
 
323 aa  209  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  42.23 
 
 
330 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  36.77 
 
 
330 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  39.74 
 
 
328 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  40.6 
 
 
346 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  41.35 
 
 
329 aa  209  7e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  40.07 
 
 
349 aa  208  8e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5949  hypothetical protein  40.38 
 
 
324 aa  208  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011365  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3056  hypothetical protein  38.38 
 
 
332 aa  208  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176831  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1674  hypothetical protein  40.69 
 
 
326 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4969  extra-cytoplasmic solute receptor  40.7 
 
 
364 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332662  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  43.11 
 
 
352 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  39.39 
 
 
331 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  43.18 
 
 
353 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  41.16 
 
 
320 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  40.97 
 
 
328 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  38.33 
 
 
332 aa  206  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  39.39 
 
 
332 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  37.54 
 
 
322 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  43.18 
 
 
328 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  37.22 
 
 
325 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  35.92 
 
 
335 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  40.34 
 
 
330 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  38.69 
 
 
328 aa  205  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  41.58 
 
 
355 aa  205  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  40.21 
 
 
335 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  35.51 
 
 
332 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4803  hypothetical protein  40.07 
 
 
474 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  37.37 
 
 
324 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  39.27 
 
 
331 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  39.71 
 
 
327 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  37.8 
 
 
349 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1270  hypothetical protein  41.89 
 
 
323 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4101  extra-cytoplasmic solute receptor  39.12 
 
 
328 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0889008  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  40.74 
 
 
362 aa  203  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3894  hypothetical protein  39.17 
 
 
327 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367386  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40.85 
 
 
358 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  39.7 
 
 
339 aa  202  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  39.36 
 
 
338 aa  202  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  39.41 
 
 
335 aa  202  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  35.4 
 
 
325 aa  202  8e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  39.29 
 
 
327 aa  202  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  41.11 
 
 
335 aa  202  8e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4625  hypothetical protein  37.94 
 
 
327 aa  202  8e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1257  hypothetical protein  40.14 
 
 
323 aa  202  9e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.37979  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  39.46 
 
 
335 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  40.96 
 
 
338 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  45.28 
 
 
330 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  40.07 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  35.55 
 
 
337 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  37.46 
 
 
326 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>